[发明专利]从细菌全基因组序列中挖掘温和型噬菌体的方法、装置和存储介质在审
| 申请号： | 201880098544.2 | 申请日： | 2018-10-17 |
| 公开（公告）号： | CN112823206A | 公开（公告）日： | 2021-05-18 |
| 发明（设计）人： | 宋文琛;孙海汐;肖敏凤;程丽;邓子卿;王云;沈玥;李俊桦 | 申请（专利权）人： | 深圳华大生命科学研究院 |
| 主分类号： | C12N7/00 | 分类号： | C12N7/00;C12Q1/70 |
| 代理公司： | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人： | 李小焦;彭家恩 |
| 地址： | 518083 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 暂无信息 | 说明书： | 暂无信息 |
| 摘要： | 提供一种从细菌全基因组序列中挖掘温和型噬菌体的方法、装置和包含能执行所述方法的程序的存储介质，所述方法包括：获取细菌全基因组序列，将温和型噬菌体的功能元件聚类比对到细菌全基因组序列上，得到功能元件呈聚簇现象的区域作为噬菌体疑似区域，其中功能元件包括假定蛋白元件、侵染元件、组装元件和未知保守元件，在噬菌体疑似区域的两端寻找重复序列，得到温和型噬菌体整合位点，从而确定温和型噬菌体的序列区域，将温和型噬菌体的序列区域作为噬菌体基因组序列进行基因组学特征分析，输出功能性噬菌体的序列信息。 | ||
| 搜索关键词： | 细菌 基因组 序列 挖掘 温和 噬菌体 方法 装置 存储 介质 | ||
【主权项】：
暂无信息
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