[发明专利]使用PARADIGM对miRNA诱导的乳腺癌中的沉默进行建模在审
申请号: | 201880034462.1 | 申请日: | 2018-03-27 |
公开(公告)号: | CN110678928A | 公开(公告)日: | 2020-01-10 |
发明(设计)人: | 安德鲁·塞奇威克;沙赫鲁兹·拉比扎德;派翠克·松吉翁;查尔斯·约瑟夫·瓦斯克 | 申请(专利权)人: | 南托米克斯有限责任公司;河谷控股IP有限责任公司 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;C12Q1/6886 |
代理公司: | 11413 北京柏杉松知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 王春伟;刘继富 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | 通过加入RISC作为调节因子,将概率图形途径模型修改为包括miRNA调节。最优选地,使用因子图建立途径模型,并且RISC包含DICER、TARBP2和AGO2或AGO1/3/4。如此构建的途径模型可用于推断RISC活性,该RISC活性与各种临床相关参数相关联以构建各种预测因子或用于诊断测试。 | ||
搜索关键词: | 构建 模型修改 相关参数 预测因子 诊断测试 因子图 可用 优选 推断 关联 概率 | ||
【主权项】:
1.一种对患者肿瘤组织中的RNA诱导的沉默复合体(RISC)活性进行定量的方法,其包括:/n从患者的肿瘤组织获得组学数据,其中所述肿瘤组织是管腔A亚型乳腺癌组织;/n使用具有多个途径元件的概率图形途径模型,由组学数据对RISC活性进行定量;/n其中概率图形途径模型中的每个途径元件由各自的因子图表示;和/n其中至少一个因子图对RISC进行建模并包含AGO1、AGO2、AGO3和AGO4中的至少一种。/n
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