[发明专利]拷贝数变异的检测方法

摘要

本发明提供一种拷贝数变异的检测方法，所述方法包含：(A)提供3个以上的检测样本；(B)纯化检测样本中的核酸；(C)将所有检测样本的核酸进行分组；(D)将分组后的所有检测样本核酸各自进行全基因组放大；(E)将分组后的检测样本核酸放大产物标定双色荧光；(F)于含有一群能专一性侦测人类基因体的探针的芯片上进行杂交；(G)进行局部加权回归散点平滑法(lowess)分析；(H)与校正用探针数值群的相对应探针数值进行比对计算；(I)将所述比对计算结果进行拷贝数变异分析，得到目标检测样本的拷贝数变异结果。本检测方法可节省参考样本的使用，有利于高通量的检测。

主权项

1.一种用于检测拷贝数变异(copy number variation)的方法，其包含：(A)提供3个以上检测样本；(B)纯化每一检测样本中核酸，得到每一检测样本的核酸；(C)将所有检测样本的核酸进行分组，每组有两个检测样本核酸，得到分组后的检测样本核酸；(D)将分组后的每一检测样本核酸各自进行全基因组放大(whole genome amplification)，得到分组后的检测样本核酸放大产物；(E)将每一分组后的检测样本核酸放大产物的其中一份检测样本核酸放大产物标定第一荧光染剂，针对每一组得到第一荧光染剂标定核酸放大产物，并将每一分组后的检测样本核酸放大产物的另一份检测样本核酸放大产物标定第二荧光染剂，针对每一组得到第二荧光染剂标定核酸放大产物；(F)将每一分组后的第一荧光染剂标定核酸放大产物与第二荧光染剂标定核酸放大产物依组别混和后，于含有一群能专一性侦测人类基因体的探针的芯片上进行杂交后，针对每一芯片产生分组检测样本讯号数据群，所述分组检测样本讯号数据群由两检测样本讯号数据群组成，且所述检测样本讯号数据群是由检测样本的每一探针讯号数据所组成的集合；(G)将每一芯片上的分组检测样本讯号数据群进行局部加权回归散点平滑法(lowess，locally weighted scatterplot smoothing)分析，从两检测样本讯号数据群得到两完成lowess分析的检测样本讯号数据群；(H)将完成lowess分析的目标检测样本讯号数据群的每一个依染色体坐标位置排列的探针讯号数据与校正用探针数值群的相对应探针数值进行比对计算，得到比对计算结果；其中校正用探针数值群的产生过程如下：(i)使用与目标检测样本同一检测批次或不同检测批次的分组检测样本讯号数据群；(ii)将至少三个完成lowess分析的检测样本讯号数据群进行计算，产生一群校正用探针数值群，而所述校正用探针数值群为每一探针的校正用探针数值的集合；(I)将所述比对计算结果进行拷贝数变异分析，得到目标检测样本的拷贝数变异结果。