[发明专利]基于全长转录组测序开发的姜荷花多态性SSR引物及试剂盒

摘要

本发明公开了一种基于全长转录组测序开发的姜荷花多态性SSR引物及试剂盒。所述引物包括20对引物，如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.40所述，一种鉴定姜荷花亲缘关系的试剂盒包括所述的引物。本发明提供的20对引物可以应用于更多的姜荷花品种和品种内群体间，进行品种鉴定、种质资源遗传多样性和亲缘关系的分析，还可应用于姜荷花的发分子标记辅助育种。

主权项

1.一种基于全长转录组测序开发的姜荷花多态性SSR引物，其特征在于，所述引物包括20对引物，分别为：P2 F: AGCAATGTTGACGAAATGGAAA (SEQ ID NO.1)，P2 R: AAGCAATCTCTTAGGAAATCAG (SEQ ID NO.2)；P5F: CTGGTCACCCACCTAAATCCTT (SEQ ID NO.3)，P5R: ACGCCGTGGAGAAGAGGCTATT (SEQ ID NO.4)；P6F: GGAGGGACTACGGGAAAGGGAA (SEQ ID NO.5)，P6R: GCAGGACAGTTACGATTGATGA (SEQ ID NO.6)；P7F: GAAAGCGACAAGATGCTGAGGG (SEQ ID NO.7)，P7R: ACCTTCCTCTTCTCCACCTGAT (SEQ ID NO.8)；P9F: GAGCCAGAAGTCACAATCAGCG (SEQ ID NO.9)，P9R: TTGTCCTGGCTTCCTCTCTGGG (SEQ ID NO.10)；P11F: CTGAGTGTAGGACTTGTCGGTG (SEQ ID NO.11)，P11R: TAGCCATTGACGAACAAAAAGC (SEQ ID NO.12)；P12F: GAAGAGCAAAAGACAGGCAGAT (SEQ ID NO.13)，P12R: CACAGACAAAGAATGAAAACTA (SEQ ID NO.14)；P13F: AGGGCGTCTTCAAGGTCTGGAT (SEQ ID NO.15)，P13R: ACAACAACGGCAGCAGCAGTAT (SEQ ID NO.16)；P14F: GCCTTTGGTATCTCTGTTCTAA (SEQ ID NO.17)，P14R: TAATGCGGTAGGAGGGGAACAA (SEQ ID NO.18)；P16F: TCTATGTTCTTCGCTACCTTCG (SEQ ID NO.19)，P16R: ACCTTTATCCTCTTGGTCTCGC (SEQ ID NO.20)；P17F: CAAAACGAGGAAAGAAACCAAA (SEQ ID NO.21)，P17R: TATGCTTGTTGGAGGCTATCAC (SEQ ID NO.22)；P18F: AGGGCAAAACTCAAAAGGGTAG (SEQ ID NO.23)，P18R: CTCCTTGTAGTCCTTGTCCTGC (SEQ ID NO.24)；P19F: AAACACAGACTGCCCTCCTTGA (SEQ ID NO.25)，P19R: TTCCCATCAGAAGATAACAACG (SEQ ID NO.26)；P21F: CGTTTCTCCAGACAATGACCGC (SEQ ID NO.27)，P21R: CGTCAACTAACTCTACGCTAAC (SEQ ID NO.28)；P23F: CCCTGGCGTAACCTCCATTTCC (SEQ ID NO.29)，P23R: GATGGCGTGGAGTATGGCGTCT (SEQ ID NO.30)；P25F: CCTGGCGTAACCTCCATTTCCG (SEQ ID NO.31)，P25R: GATGGCGTGGAGTATGGCGTCT (SEQ ID NO.32)；P26F: ACTCGCCAATCTCTTACACAGC (SEQ ID NO.33)，P26R: TCGGGGTAATGGTGACGGTAAG (SEQ ID NO.34)；P27F: TTTCACCAGGAGTAAGAGGGAT (SEQ ID NO.35)，P27R: AAACCTCAGCCTTTTCTCTTCA (SEQ ID NO.36)；P31F: CAGCCGTTTGTTATGCTACTTA (SEQ ID NO.37)，P31R: TTGAAACTTTACCAAGAACAGG (SEQ ID NO.38)；P33F: GTCAAACTTCTCAAACCACACG (SEQ ID NO.39)，P33R: ATCATACAATACCCTCAACAAT (SEQ ID NO.40)。