[发明专利]一种基于多组学的miRNA功能识别方法在审
申请号: | 201810926074.6 | 申请日: | 2018-08-14 |
公开(公告)号: | CN109033748A | 公开(公告)日: | 2018-12-18 |
发明(设计)人: | 王颖;汝吉东 | 申请(专利权)人: | 齐齐哈尔大学 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18;G06F19/20 |
代理公司: | 齐齐哈尔鹤城专利事务所 23207 | 代理人: | 刘丽 |
地址: | 161006 黑龙江*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 一种基于多组学的miRNA功能识别方法,本发明涉及基于多组学的miRNA功能识别方法。本发明为了解决现有方法对miRNA功能识别准确率低的问题。本发明通过基因表达谱分析差异表达基因;构建疾病或药物相关蛋白质网络;对构建的疾病或药物相关的蛋白质网络,进行功能模块的选取;对选取的功能模块进行富集分析,确定功能模块内的关键基因;通过miRNA表达谱分析差异表达miRNA,对差异表达miRNA进行靶基因预测;构建miRNA调控的疾病或药物相关蛋白质网络;对构建的miRNA调控的疾病或药物相关蛋白质网络的结点基因进行功能富集分析,识别miRNA的功能。本发明用于生物信息学领域。 | ||
搜索关键词: | 蛋白质网络 功能识别 构建 组学 疾病 差异表达 富集 基因表达谱分析 生物信息学领域 差异表达基因 靶基因预测 关键基因 分析 调控 准确率 结点 基因 | ||
【主权项】:
1.一种基于多组学的miRNA功能识别方法,其特征在于:所述基于多组学的miRNA功能识别方法包括以下步骤:步骤一:通过基因表达谱计算基因P值,选定差异表达基因,即为疾病或药物相关基因;步骤二:根据步骤一选定的差异表达基因,构建疾病或药物相关蛋白质网络;步骤三:对步骤二构建的疾病或药物相关的蛋白质网络,进行功能模块的选取;所述功能模块是指在疾病或用药条件下蛋白质网络中总体表达量显著差异的子网;步骤四:对步骤三选取的功能模块进行富集分析,确定功能模块内的关键基因;步骤五:通过miRNA表达谱分析差异表达miRNA,对差异表达miRNA进行靶基因预测;步骤六:将步骤五中差异表达miRNA的靶基因与功能模块中结点取交集,构建miRNA调控的疾病或药物相关蛋白质网络;步骤七:对步骤六构建的miRNA调控的疾病或药物相关蛋白质网络的结点基因进行功能富集分析,识别miRNA的功能。
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