[发明专利]一种基因多态性检测探针的筛选方法

摘要

本发明涉及基因多态性检测探针的筛选方法，包括以下步骤：(1)根据细菌16S rDNA保守区设计出通用探针，且设计出包含突变位点的模板序列；(2)根据GeneBank数据库的待测基因突变位点碱基序列，设计涵盖多态位点的多对筛选引物P1和多对筛选引物P2；(3)逐一取步骤(2)设计获得的多对筛选引物P1和多对筛选引物P2中的一对，分别与步骤(1)设计获得的通用探针、模板序列进行退火反应，筛选获得优选的模板序列；(4)根据优选的模板序列，合成与之匹配的荧光探针，即为最终的优选探针。本发明的基因多态性检测探针的筛选方法可避免因大量的探针筛选而引起的成本高和研发效率低的问题。

主权项

1.一种基因多态性检测探针的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)根据细菌16S rDNA保守区设计出通用探针，且设计出包含突变位点的模板序列；将通用探针顺序分为第一通用探针序列和第二通用探针序列；将模板序列顺序分成第一模板序列和第二模板序列；(2)根据GeneBank数据库的待测基因突变位点碱基序列，设计涵盖多态位点的多对筛选引物P1和多对筛选引物P2；将筛选引物P1顺序分成第一引物序列和第二引物序列；筛选引物P2顺序分成第三引物序列和第四引物序列；其中，多对筛选引物P1和多对筛选引物P2的设计满足以下设计原则：设计第一引物序列与第一模板序列互补；设计第三引物序列与第二模板序列互补；设计第二引物序列与第一通用探针序列互补，设计第四引物序列与第二通用探针序列互补；(3)逐一取步骤(2)设计获得的多对筛选引物P1和多对筛选引物P2中的一对筛选引物P1和一对筛选引物P2，分别与步骤(1)设计获得的通用探针、模板序列进行退火反应，筛选获得优选的筛选引物P1和筛选引物P2，进而筛选获得优选的模板序列；(4)根据优选的模板序列，合成与之匹配的荧光探针，即为最终的优选探针。