[发明专利]基因调控性染色质相互作用的鉴定方法、系统及其应用有效
| 申请号： | 201810011140.7 | 申请日： | 2018-01-05 |
| 公开（公告）号： | CN108220394B | 公开（公告）日： | 2021-03-23 |
| 发明（设计）人： | 陈阳;李炎剑;贺毅;张奇伟 | 申请（专利权）人： | 清华大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6809 | 分类号： | C12Q1/6809 |
| 代理公司： | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人： | 彭鲲鹏;韩宏星 |
| 地址： | 100084*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种运用多种基因组分析技术，例如RNA‑seq、ChIP‑seq或Hi‑C等手段，对经历状态转变(例如细胞分化)的样品的目标特性进行多方面表征和分析，从而识别出基因调控性染色质相互作用的方法，特别涉及一种鉴定在样品状态转变过程中，与样品状态转变相关的染色质相互作用和相关基因的方法。 | ||
| 搜索关键词： | 基因 调控 染色质 相互作用 鉴定 方法 系统 及其 应用 | ||
【主权项】：
1.一种样品状态转变效应基因的鉴定方法，所述效应基因的表达受到样品状态转变中染色质相互作用变化的影响，其包括下列步骤：(1)对处于第一状态和第二状态的样品进行比较，从而至少获得下列差异信息：基因可识别行为差异，以及存在于基因转录调控区域的染色质相互作用差异，和(2)将步骤(1)获得的差异信息建立关联，获得与状态转变中转录调控区域的染色质相互作用差异有关的基因可识别行为差异，从而鉴定所述效应基因。
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