[发明专利]基于具有嵌入纠错机制的伪彩色条形码的分子靶的顺序探测

摘要

本发明，除其他以外，提供用于检测和/或定量细胞、组织、器官或生物体中的核酸的技术。预先设计的条形码通过顺序杂交实验与特定分子靶缔合。开发了一种基于伪彩色的加条形码方案，以克服上一代技术中的限制，诸如进行原位实验时，缺乏能够与细胞内的探针或微小内部相关联的视觉信号。本方法可应用于体外和原位分析二者。根据该方法，每个加条形码轮次包括多个连续杂交，其中在连续杂交轮次内的每个杂交实验中使用少量有色信号(与探针相关联)。来自同一连续杂交轮次内的每个连续杂交实验的图像被组合以形成每个加条形码轮次的复合图像。在每个加条形码轮次中，分析同一集合的分子靶。完成所有加条形码轮次后，条形码与这些分子靶的关联完成。

主权项

1.一种为分子靶加条形码的方法，包括：识别生物样品中的N个分子靶，其中所述N个分子靶是被固定的；经由n个顺序加条形码轮次(其中n≥2)使独特条形码与每个分子靶缔合，其中每个加条形码轮次包括探针共同地与所述N个分子靶结合的m个连续杂交(其中m≥2)，其中每个连续杂交包括：使一个或更多个组的探针与所述N个分子靶的子集接触，探针的总组数对应于所述子集中分子靶的数目，其中每组中的探针包含特异性靶向所述子集中的一个分子靶的一个或更多个结合序列，其中每个探针能够生成表示所述探针与所述子集中的一个分子靶的结合的至少一个可检测视觉信号，并且其中所述一个或更多个组中的探针生成对应于所述子集中的分子靶的数目的一个或更多个不同的可检测视觉信号；检测反映所述一个或更多个组的探针和所述N个分子靶的子集之间的结合的可检测视觉信号；和当适用时，在下一次连续杂交之前去除所述视觉信号；其中每个分子靶的独特条形码由n个分量组成，每个分量由S个独特符号指定，其中S是等于或大于的整数；和任选地，在两个加条形码轮次之间移除探针。