[发明专利]一种用于对不同银杏进行基因分型的SNP引物及检测方法

摘要

本发明公开了一种用于对不同银杏进行基因分型的SNP引物及检测方法。本发明的引物共22对，其中11对SNP引物组合可以用于构建银杏古树名木的指纹图谱。本发明利用银杏转录组数据开发的SNP引物能够对银杏不同个体进行基因分型，并且本发明操作方法简单，通量高，成本低。此外，本发明开发的11对SNP引物构建了不同群体中银杏古树名木的指纹图谱，验证的22个SNP位点还可以用来分子标记辅助育种，遗传多样性研究，基于SNP的关联分析，以及用于种质资源鉴定与分类等。

主权项

1.一种用于对不同银杏进行基因分型的SNP引物，其特征在于，由11对引物组成，各引物的核苷酸序列如下表所示：引物名称上游引物（5’ to 3’）下游引物（5’ to 3’）SNP1TTTGTATGAATGCCCTCTTGCTCAAGGAAGTCGTGCAGAAGCTCSNP4CATTGACAGAGATTAGAAAGGTCAAACGATACAAAAAGTGACSNP6ACTTTTGGTGCTCAGACTGGTTTATTCTCAAGGATGCCCCCACASNP8CTTGTAGCCATTTGTCACTGCAAGGCTTAGGATTGACATCTCSNP10CTTAGGGTCCGATTTGGGCTGAGCGTATTTTGGATGCGGATTSNP14AGACTGTGTTACTGGTATCATGCATCTGGTCATCACTACTAASNP16GCTTACCTGAAACACGGCACCAAGCGATGTTGTACGAGACCSNP17ATAATGTCTCCAGGCAGTGCCAGAGTGAGAAGTCGTSNP19GTATTATTGTATGGCAGGGAAGTGGAAGAAGGAATGACAGTGCTSNP20ATCTATCTACCCCTTGTTATGGCCTTCAATCAAAGTATTCTGSNP22GTGATTGAGGAAGCCCATTAGCACAGAACAGTCAGATAAACC其中，银杏为下表中的84种：。