[发明专利]提取林木组织或器官RNA的方法和鉴定林木组织特异性miRNA的方法在审
| 申请号： | 201710252442.9 | 申请日： | 2017-04-18 |
| 公开（公告）号： | CN108504652A | 公开（公告）日： | 2018-09-07 |
| 发明（设计）人： | 张德强;谢剑波;张全锋 | 申请（专利权）人： | 北京林业大学 |
| 主分类号： | C12N15/10 | 分类号： | C12N15/10 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 赵天月 |
| 地址： | 100083 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提出了一种提取林木组织或器官RNA的方法、林木特异性条形码(barcode)序列设计和鉴定林木组织特异性miRNA的方法。提取林木组织或器官RNA的方法包括：将待处理样品与交联聚乙烯吡咯烷酮(PVPP)进行第一接触，并在液氮条件下进行研磨处理，将研磨处理后产物与Trizol、β‑巯基乙醇和聚乙烯吡咯烷酮(PVP)进行第二接触。利用该方法，避免了因植物组织中富含多糖、酚类、色素等物质而导致RNA提取效率和成功率不高的缺陷，利用上述方法，植物组织RNA的提取效率和成功率显著提高，同时发明人发现，相比于现有技术，节约了约80％的样品用量，极大方便了微量样品的测序；此外，林木特异性barcode序列的使用提高了测序碱基的平衡度，测序产出至少提高5％，且测序质量也会不同程度的提高。 | ||
| 搜索关键词： | 林木 测序 组织特异性 器官 研磨处理 成功率 交联聚乙烯吡咯烷酮 聚乙烯吡咯烷酮 植物组织RNA 测序碱基 提取效率 微量样品 序列设计 样品用量 植物组织 巯基乙醇 条形码 平衡度 酚类 富含 色素 液氮 节约 发现 | ||
【主权项】：
1.一种提取林木组织或器官RNA的方法，其特征在于，包括：将待处理样品与交联聚乙烯吡咯烷酮进行第一接触，并在液氮条件下进行研磨处理，将研磨处理后产物与Trizol、β‑巯基乙醇和聚乙烯吡咯烷酮进行第二接触。
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