[发明专利]一种基于动态关联分析挖掘玉米籽粒油脂代谢机制的方法有效
| 申请号： | 201710169264.3 | 申请日： | 2017-03-21 |
| 公开（公告）号： | CN106929579B | 公开（公告）日： | 2020-10-27 |
| 发明（设计）人： | 李慧;许秀勤;车荣会;裴腊明;李鹏;何琳琳;高幸幸 | 申请（专利权）人： | 济南大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/6895;G16B40/00;G16B25/10 |
| 代理公司： | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人： | 李桂存 |
| 地址： | 250022 山东*** | 国省代码： | 山东;37 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明属于植物分子生物技术和基因工程领域，具体涉及一种基于动态关联分析挖掘玉米籽粒油脂代谢机制的方法，具体如下：收集玉米自交系基因表达量数据；收集与玉米籽粒含油量相关联的基因数据；收集玉米自交系组成的关联群体的籽粒含油量数据；动态关联分析LA模型的建立；全基因组范围内挖掘调控26个含油量关联基因共表达模式动态变化的的调控基因及鉴定与26个含油量关联基因共表达模式动态关联的候选基因；对候选基因进行功能注释；检测候选基因是否落在油份性状的QTL区间内；与玉米自交系的油份表型数据进行区段关联分析。本发明以调控已知的油份关联基因共表达模式动态关联为突破口，可快速有效的鉴定调控籽粒油脂代谢的调控基因。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 动态 关联 分析 挖掘 玉米 籽粒 油脂 代谢 机制 方法 | ||
【主权项】：
一种基于动态关联分析挖掘玉米籽粒油脂代谢机制的方法，其特征在于，所述机制包括调控机制及遗传和分子机制，均包括以下步骤：（1）收集玉米自交系授粉后15天的籽粒转录本测序获得基因表达量数据；（2）收集26个与玉米籽粒含油量相关联的基因数据；（3）收集玉米自交系组成的关联群体的籽粒含油量数据；（4）动态关联分析LA模型的建立；（5）全基因组范围内挖掘调控26个含油量关联基因共表达模式动态变化的的调控基因及全基因范围内鉴定与26个含油量关联基因共表达模式动态关联的候选基因；（6）对候选基因进行功能注释；（7）检测候选基因是否落在油份性状的QTL区间内；（8）提取候选基因上下游100kb范围内的所有SNP标记，与玉米自交系的油份表型数据进行区段关联分析。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于济南大学，未经济南大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201710169264.3/，转载请声明来源钻瓜专利网。
