[发明专利]用于细胞系鉴定的21位点STR数据库的建立方法及细胞鉴定及匹配率的计算方法和系统在审

专利信息
申请号: 201710108853.0 申请日: 2017-02-27
公开(公告)号: CN106894095A 公开(公告)日: 2017-06-27
发明(设计)人: 沈超;朱欢;刘晏瑞;刘月红;袁冰;徐国东;郑从义 申请(专利权)人: 武汉大学;武汉珈创生物技术股份有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;G06F19/22;G06F17/30
代理公司: 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙)42222 代理人: 鲁力
地址: 430072 湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明涉及用于细胞系鉴定的21位点STR数据库的建立方法及细胞鉴定及匹配率的计算方法和系统,通过检测得到多个细胞系的21个位点数据;建立数据表,以获得所述21位点STR数据库,数据表包含21组STR位点数据记录,一组记录对应一个STR位点,每组记录包含至多三条STR位点记录。在21位点STR数据库的基础上,本发明提供了三种鉴定未知细胞的方法CCTCC、ATCC、DSMZ数据库匹配率计算。此外,本发明还提供了一种计算两株未知细胞亲缘性的方法。本发明数据库的另一优点在于,可以根据待测细胞任选的,至少9个至多21个STR位点的来计算其与数据库中已知细胞系间的匹配率,从而来鉴定其细胞系种类。
搜索关键词: 用于 细胞系 鉴定 21 str 数据库 建立 方法 细胞 匹配 计算方法 系统
【主权项】:
一种用于细胞系鉴定的21位点STR数据库的建立方法,其特征在于,21个STR位点包括ATCC与DSMZ中的9个位点,以及D19S433、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、Penta D、D2S441、D8S1179、Penta E、D12S391、D2S1338、FGA的12个位点,具体包括:步骤1,通过检测得到多个细胞系的21个位点数据;步骤2,建立数据表,以获得所述21位点STR数据库,所述数据表包含21组STR位点数据记录,一组记录对应一个STR位点,每组记录包含至少两条STR位点记录;所述数据表包含多个字段,所述字段包含:字段一:STR位点名称,字段二:STR位点特征数字段三:是/否能为空。
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