[发明专利]一种建立胃癌的风险预测模型的方法在审

专利信息
申请号: 201710108343.3 申请日: 2017-02-27
公开(公告)号: CN108504732A 公开(公告)日: 2018-09-07
发明(设计)人: 张骏;刘杰;胡婧怡;马彦云;王存久 申请(专利权)人: 复旦大学附属华山医院;复旦大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886
代理公司: 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 代理人: 吴桂琴
地址: 200031 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及肿瘤的分子生物学技术领域,涉及一种建立预测胃癌风险的预测模型的方法,本发明从采集的生物学样本中测定多个单核苷酸多态性(SNP)位点,建立预测胃癌风险的预测模型,通过建立的模型对单核苷酸多态性(SNP)位点比较分析判定预测人群罹患胃癌的风险以及从受试者胃癌诊断的角度上预测与胃癌发生风险的相关性。本发明通过建立的预测模型法可从受试者采集的生物学样本中,通过对照分析正常人群和胃癌病人并根据基因变异的频率将具统计显著性的单核苷酸变异进行分析,并从受试者胃癌诊断的角度上判定与胃癌发生风险的相关性,从而提高早期诊断率,改善临床结果;所述风险预测模型适用于预测人群罹患胃癌的风险。
搜索关键词: 胃癌 预测模型 预测 单核苷酸多态性 生物学样本 风险预测 胃癌发生 胃癌诊断 位点 判定 分子生物学技术 单核苷酸变异 采集 统计显著性 比较分析 基因变异 临床结果 早期诊断 正常人群 人群 分析 肿瘤
【主权项】:
1.一种建立预测胃癌风险的预测模型的方法,其特征在于,其包括步骤:1) 采集生物学样本,将采集的正常人和胃癌患者外周血样本,分离DNA,进行基因分型,将包含单核苷酸多态性SNP位点SNP位点区域的 DNA扩增,将特异的延伸引物与 PCR产物进行单碱基延伸反应,通过检测延伸产物分子量的大小,对SNP作分型检测;2)测定多个单核苷酸多态性位点,包括所述单核苷酸多态性位点基因频率,并矫正受试者的年龄、性别、吸烟、饮酒状况,进行逻辑回归,确定位点的统计显著性;通过逻辑回归得到算式LogitP,以诊断类型为状态变量作出受试者工作曲线ROC曲线,预测胃癌发生的 ROC 下面积AUC,灵敏度Sensitivity为0.74时特异性为0.91,建立得预测模型。
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