[发明专利]一种用于结核分枝杆菌分型SNP位点的试剂盒及其应用

摘要

本发明涉及一种用于结核分枝杆菌分型snp位点的试剂盒及其应用。具体而言，本发明提供了一种检测结核分枝杆菌SNP位点的试剂盒、相应的应用以及一种对结核分枝杆菌进行分型和进化分析的方法。上述试剂盒、应用和方法涉及包括SNP位点1～285的SNP集合，通过该SNP集合能够将结核分枝杆菌细分为7个大谱系和67个亚谱系、M.bovis谱系及其亚谱系M.bovis1，显著提高了SNP在结核分枝杆菌中的分辨率。

主权项

一种检测结核分枝杆菌SNP位点的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中包括用于检测SNP集合的试剂和/或组件，所述SNP集合包括以下一个或多个SNP位点，所述SNP位点的物理位置是基于结核分枝杆菌H37Rv的全基因组序列比对确定的，所述结核分枝杆菌H37Rv的全基因组序列的Accesion Number为NC_000962.3：SNP位点1：位于结核分枝杆菌染色体上第107791位，其核苷酸为C/T；SNP位点2：位于结核分枝杆菌染色体上第108136位，其核苷酸为C/A；SNP位点3：位于结核分枝杆菌染色体上第108181位，其核苷酸为C/T；SNP位点4：位于结核分枝杆菌染色体上第109040位，其核苷酸为G/A；SNP位点5：位于结核分枝杆菌染色体上第110395位，其核苷酸为G/C；SNP位点6：位于结核分枝杆菌染色体上第111848位，其核苷酸为G/A；SNP位点7：位于结核分枝杆菌染色体上第112333位，其核苷酸为G/A；SNP位点8：位于结核分枝杆菌染色体上第112490位，其核苷酸为G/A；SNP位点9：位于结核分枝杆菌染色体上第112734位，其核苷酸为G/A；SNP位点10：位于结核分枝杆菌染色体上第113139位，其核苷酸为G/A；SNP位点11：位于结核分枝杆菌染色体上第114695位，其核苷酸为G/A；SNP位点12：位于结核分枝杆菌染色体上第116225位，其核苷酸为C/G；SNP位点13：位于结核分枝杆菌染色体上第154049位，其核苷酸为A/G；SNP位点14：位于结核分枝杆菌染色体上第200152位，其核苷酸为T/C；SNP位点15：位于结核分枝杆菌染色体上第200377位，其核苷酸为C/T；SNP位点16：位于结核分枝杆菌染色体上第200695位，其核苷酸为T/G；SNP位点17：位于结核分枝杆菌染色体上第201894位，其核苷酸为A/G；SNP位点18：位于结核分枝杆菌染色体上第204424位，其核苷酸为T/C；SNP位点19：位于结核分枝杆菌染色体上第204502位，其核苷酸为C/G；SNP位点20：位于结核分枝杆菌染色体上第207077位，其核苷酸为G/C；SNP位点21：位于结核分枝杆菌染色体上第207590位，其核苷酸为G/A；SNP位点22：位于结核分枝杆菌染色体上第208297位，其核苷酸为C/T；SNP位点23：位于结核分枝杆菌染色体上第258921位，其核苷酸为C/T；SNP位点24：位于结核分枝杆菌染色体上第259689位，其核苷酸为G/A；SNP位点25：位于结核分枝杆菌染色体上第301341位，其核苷酸为C/A；SNP位点26：位于结核分枝杆菌染色体上第392506位，其核苷酸为A/G；SNP位点27：位于结核分枝杆菌染色体上第451896位，其核苷酸为T/C；SNP位点28：位于结核分枝杆菌染色体上第452064位，其核苷酸为T/G；SNP位点29：位于结核分枝杆菌染色体上第500533位，其核苷酸为G/A；SNP位点30：位于结核分枝杆菌染色体上第501001位，其核苷酸为T/C；SNP位点31：位于结核分枝杆菌染色体上第516658位，其核苷酸为C/G；SNP位点32：位于结核分枝杆菌染色体上第580011位，其核苷酸为A/G；SNP位点33：位于结核分枝杆菌染色体上第643386位，其核苷酸为A/C；SNP位点34：位于结核分枝杆菌染色体上第643751位，其核苷酸为T/G；SNP位点35：位于结核分枝杆菌染色体上第644442位，其核苷酸为C/T；SNP位点36：位于结核分枝杆菌染色体上第644475位，其核苷酸为T/C；SNP位点37：位于结核分枝杆菌染色体上第646051位，其核苷酸为C/G；SNP位点38：位于结核分枝杆菌染色体上第646166位，其核苷酸为C/A；SNP位点39：位于结核分枝杆菌染色体上第646246位，其核苷酸为T/C；SNP位点40：位于结核分枝杆菌染色体上第732555位，其核苷酸为A/G；SNP位点41：位于结核分枝杆菌染色体上第738045位，其核苷酸为A/C；SNP位点42：位于结核分枝杆菌染色体上第752017位，其核苷酸为C/T；SNP位点43：位于结核分枝杆菌染色体上第752049位，其核苷酸为C/T；SNP位点44：位于结核分枝杆菌染色体上第770391位，其核苷酸为G/A；SNP位点45：位于结核分枝杆菌染色体上第962104位，其核苷酸为A/G；SNP位点46：位于结核分枝杆菌染色体上第962136位，其核苷酸为G/T；SNP位点47：位于结核分枝杆菌染色体上第1061309位，其核苷酸为G/A；SNP位点48：位于结核分枝杆菌染色体上第1129169位，其核苷酸为G/A；SNP位点49：位于结核分枝杆菌染色体上第1143318位，其核苷酸为C/A；SNP位点50：位于结核分枝杆菌染色体上第1149132位，其核苷酸为C/T；SNP位点51：位于结核分枝杆菌染色体上第1149551位，其核苷酸为C/T；SNP位点52：位于结核分枝杆菌染色体上第1150494位，其核苷酸为C/G；SNP位点53：位于结核分枝杆菌染色体上第1219669位，其核苷酸为G/C；SNP位点54：位于结核分枝杆菌染色体上第1219828位，其核苷酸为G/T；SNP位点55：位于结核分枝杆菌染色体上第1225203位，其核苷酸为C/T；SNP位点56：位于结核分枝杆菌染色体上第1228121位，其核苷酸为A/G；SNP位点57：位于结核分枝杆菌染色体上第1235550位，其核苷酸为G/T；SNP位点58：位于结核分枝杆菌染色体上第1271192位，其核苷酸为C/G；SNP位点59：位于结核分枝杆菌染色体上第1310360位，其核苷酸为G/T；SNP位点60：位于结核分枝杆菌染色体上第1324571位，其核苷酸为G/A；SNP位点61：位于结核分枝杆菌染色体上第1324730位，其核苷酸为C/A；SNP位点62：位于结核分枝杆菌染色体上第1324997位，其核苷酸为C/T；SNP位点63：位于结核分枝杆菌染色体上第1325171位，其核苷酸为C/T；SNP位点64：位于结核分枝杆菌染色体上第1326802位，其核苷酸为T/G；SNP位点65：位于结核分枝杆菌染色体上第1347179位，其核苷酸为C/T；SNP位点66：位于结核分枝杆菌染色体上第1377574位，其核苷酸为A/G；SNP位点67：位于结核分枝杆菌染色体上第1378731位，其核苷酸为T/C；SNP位点68：位于结核分枝杆菌染色体上第1386928位，其核苷酸为C/T；SNP位点69：位于结核分枝杆菌染色体上第1386970位，其核苷酸为C/T；SNP位点70：位于结核分枝杆菌染色体上第1421046位，其核苷酸为C/G；SNP位点71：位于结核分枝杆菌染色体上第1421115位，其核苷酸为A/G；SNP位点72：位于结核分枝杆菌染色体上第1421314位，其核苷酸为T/G；SNP位点73：位于结核分枝杆菌染色体上第1460672位，其核苷酸为C/T；SNP位点74：位于结核分枝杆菌染色体上第1486653位，其核苷酸为G/C；SNP位点75：位于结核分枝杆菌染色体上第1494800位，其核苷酸为C/T；SNP位点76：位于结核分枝杆菌染色体上第1495332位，其核苷酸为A/G；SNP位点77：位于结核分枝杆菌染色体上第1501474位，其核苷酸为G/C；SNP位点78：位于结核分枝杆菌染色体上第1502126位，其核苷酸为C/A；SNP位点79：位于结核分枝杆菌染色体上第1502348位，其核苷酸为T/G；SNP位点80：位于结核分枝杆菌染色体上第1505476位，其核苷酸为C/G；SNP位点81：位于结核分枝杆菌染色体上第1505812位，其核苷酸为C/T；SNP位点82：位于结核分枝杆菌染色体上第1510163位，其核苷酸为G/A；SNP位点83：位于结核分枝杆菌染色体上第1581733位，其核苷酸为G/A；SNP位点84：位于结核分枝杆菌染色体上第1586540位，其核苷酸为C/A；SNP位点85：位于结核分枝杆菌染色体上第1587020位，其核苷酸为A/G；SNP位点86：位于结核分枝杆菌染色体上第1588462位，其核苷酸为A/G；SNP位点87：位于结核分枝杆菌染色体上第1597411位，其核苷酸为G/A；SNP位点88：位于结核分枝杆菌染色体上第1656977位，其核苷酸为G/T；SNP位点89：位于结核分枝杆菌染色体上第1658036位，其核苷酸为C/T；SNP位点90：位于结核分枝杆菌染色体上第1706040位，其核苷酸为A/G；SNP位点91：位于结核分枝杆菌染色体上第1719328位，其核苷酸为G/A；SNP位点92：位于结核分枝杆菌染色体上第1719685位，其核苷酸为T/C；SNP位点93：位于结核分枝杆菌染色体上第1719829位，其核苷酸为A/G；SNP位点94：位于结核分枝杆菌染色体上第1776441位，其核苷酸为G/C；SNP位点95：位于结核分枝杆菌染色体上第1790486位，其核苷酸为C/G；SNP位点96：位于结核分枝杆菌染色体上第1791511位，其核苷酸为C/T；SNP位点97：位于结核分枝杆菌染色体上第1793509位，其核苷酸为G/A；SNP位点98：位于结核分枝杆菌染色体上第1849198位，其核苷酸为T/C；SNP位点99：位于结核分枝杆菌染色体上第1850089位，其核苷酸为T/C；SNP位点100：位于结核分枝杆菌染色体上第1851055位，其核苷酸为A/C；SNP位点101：位于结核分枝杆菌染色体上第1867845位，其核苷酸为G/A；SNP位点102：位于结核分枝杆菌染色体上第1919743位，其核苷酸为T/G；SNP位点103：位于结核分枝杆菌染色体上第1919952位，其核苷酸为C/T；SNP位点104：位于结核分枝杆菌染色体上第2066477位，其核苷酸为G/A；SNP位点105：位于结核分枝杆菌染色体上第2066478位，其核苷酸为T/C；SNP位点106：位于结核分枝杆菌染色体上第2067686位，其核苷酸为C/T；SNP位点107：位于结核分枝杆菌染色体上第2095241位，其核苷酸为C/A；SNP位点108：位于结核分枝杆菌染色体上第2095536位，其核苷酸为G/A；SNP位点109：位于结核分枝杆菌染色体上第2183228位，其核苷酸为G/A；SNP位点110：位于结核分枝杆菌染色体上第2192357位，其核苷酸为C/T；SNP位点111：位于结核分枝杆菌染色体上第2192591位，其核苷酸为G/A；SNP位点112：位于结核分枝杆菌染色体上第2202589位，其核苷酸为G/T；SNP位点113：位于结核分枝杆菌染色体上第2202946位，其核苷酸为A/C；SNP位点114：位于结核分枝杆菌染色体上第2283874位，其核苷酸为A/C；SNP位点115：位于结核分枝杆菌染色体上第2294813位，其核苷酸为G/A；SNP位点116：位于结核分枝杆菌染色体上第2295025位，其核苷酸为T/G；SNP位点117：位于结核分枝杆菌染色体上第2295037位，其核苷酸为T/G；SNP位点118：位于结核分枝杆菌染色体上第2295046位，其核苷酸为T/A；SNP位点119：位于结核分枝杆菌染色体上第2295050位，其核苷酸为A/G；SNP位点120：位于结核分枝杆菌染色体上第2296751位，其核苷酸为C/T；SNP位点121：位于结核分枝杆菌染色体上第2298201位，其核苷酸为C/T；SNP位点122：位于结核分枝杆菌染色体上第2300672位，其核苷酸为G/A；SNP位点123：位于结核分枝杆菌染色体上第2300950位，其核苷酸为T/C；SNP位点124：位于结核分枝杆菌染色体上第2303765位，其核苷酸为T/C；SNP位点125：位于结核分枝杆菌染色体上第2304076位，其核苷酸为C/A；SNP位点126：位于结核分枝杆菌染色体上第2329272位，其核苷酸为C/T；SNP位点127：位于结核分枝杆菌染色体上第2329474位，其核苷酸为C/T；SNP位点128：位于结核分枝杆菌染色体上第2371795位，其核苷酸为G/T；SNP位点129：位于结核分枝杆菌染色体上第2371796位，其核苷酸为A/G；SNP位点130：位于结核分枝杆菌染色体上第2462421位，其核苷酸为C/T；SNP位点131：位于结核分枝杆菌染色体上第2496838位，其核苷酸为G/A；SNP位点132：位于结核分枝杆菌染色体上第2505093位，其核苷酸为G/A；SNP位点133：位于结核分枝杆菌染色体上第2512762位，其核苷酸为C/A；SNP位点134：位于结核分枝杆菌染色体上第2514875位，其核苷酸为G/A；SNP位点135：位于结核分枝杆菌染色体上第2527686位，其核苷酸为G/A；SNP位点136：位于结核分枝杆菌染色体上第2547004位，其核苷酸为G/T；SNP位点137：位于结核分枝杆菌染色体上第2547251位，其核苷酸为T/C；SNP位点138：位于结核分枝杆菌染色体上第2549266位，其核苷酸为G/A；SNP位点139：位于结核分枝杆菌染色体上第2549313位，其核苷酸为A/C；SNP位点140：位于结核分枝杆菌染色体上第2549735位，其核苷酸为T/G；SNP位点141：位于结核分枝杆菌染色体上第2610132位，其核苷酸为A/G；SNP位点142：位于结核分枝杆菌染色体上第2610354位，其核苷酸为G/C；SNP位点143：位于结核分枝杆菌染色体上第2654653位，其核苷酸为C/T；SNP位点144：位于结核分枝杆菌染色体上第2654706位，其核苷酸为G/A；SNP位点145：位于结核分枝杆菌染色体上第2672399位，其核苷酸为T/C；SNP位点146：位于结核分枝杆菌染色体上第2672617位，其核苷酸为G/A；SNP位点147：位于结核分枝杆菌染色体上第2672916位，其核苷酸为G/A；SNP位点148：位于结核分枝杆菌染色体上第2673609位，其核苷酸为G/A；SNP位点149：位于结核分枝杆菌染色体上第2673711位，其核苷酸为C/T；SNP位点150：位于结核分枝杆菌染色体上第2673858位，其核苷酸为C/A；SNP位点151：位于结核分枝杆菌染色体上第2681585位，其核苷酸为G/A；SNP位点152：位于结核分枝杆菌染色体上第2682603位，其核苷酸为C/T；SNP位点153：位于结核分枝杆菌染色体上第2775550位，其核苷酸为G/A；SNP位点154：位于结核分枝杆菌染色体上第2789351位，其核苷酸为A/C；SNP位点155：位于结核分枝杆菌染色体上第2789808位，其核苷酸为G/T；SNP位点156：位于结核分枝杆菌染色体上第2789851位，其核苷酸为G/A；SNP位点157：位于结核分枝杆菌染色体上第2790588位，其核苷酸为G/A；SNP位点158：位于结核分枝杆菌染色体上第2810392位，其核苷酸为C/T；SNP位点159：位于结核分枝杆菌染色体上第2810826位，其核苷酸为T/C；SNP位点160：位于结核分枝杆菌染色体上第2817168位，其核苷酸为C/A；SNP位点161：位于结核分枝杆菌染色体上第2818256位，其核苷酸为C/T；SNP位点162：位于结核分枝杆菌染色体上第2859840位，其核苷酸为C/T；SNP位点163：位于结核分枝杆菌染色体上第2860223位，其核苷酸为G/A；SNP位点164：位于结核分枝杆菌染色体上第2860313位，其核苷酸为G/A；SNP位点165：位于结核分枝杆菌染色体上第2872966位，其核苷酸为G/A；SNP位点166：位于结核分枝杆菌染色体上第2884007位，其核苷酸为A/G；SNP位点167：位于结核分枝杆菌染色体上第2996922位，其核苷酸为C/T；SNP位点168：位于结核分枝杆菌染色体上第2997335位，其核苷酸为C/T；SNP位点169：位于结核分枝杆菌染色体上第3012844位，其核苷酸为C/A；SNP位点170：位于结核分枝杆菌染色体上第3016914位，其核苷酸为C/T；SNP位点171：位于结核分枝杆菌染色体上第3016953位，其核苷酸为G/C；SNP位点172：位于结核分枝杆菌染色体上第3017144位，其核苷酸为G/T；SNP位点173：位于结核分枝杆菌染色体上第3017286位，其核苷酸为A/G；SNP位点174：位于结核分枝杆菌染色体上第3050372位，其核苷酸为C/A；SNP位点175：位于结核分枝杆菌染色体上第3051081位，其核苷酸为G/A；SNP位点176：位于结核分枝杆菌染色体上第3118829位，其核苷酸为C/T；SNP位点177：位于结核分枝杆菌染色体上第3118986位，其核苷酸为C/G；SNP位点178：位于结核分枝杆菌染色体上第3151823位，其核苷酸为G/A；SNP位点179：位于结核分枝杆菌染色体上第3152267位，其核苷酸为C/T；SNP位点180：位于结核分枝杆菌染色体上第3152431位，其核苷酸为T/C；SNP位点181：位于结核分枝杆菌染色体上第3169022位，其核苷酸为C/T；SNP位点182：位于结核分枝杆菌染色体上第3194244位，其核苷酸为G/A；SNP位点183：位于结核分枝杆菌染色体上第3219800位，其核苷酸为G/A；SNP位点184：位于结核分枝杆菌染色体上第3285955位，其核苷酸为C/G；SNP位点185：位于结核分枝杆菌染色体上第3286799位，其核苷酸为G/A；SNP位点186：位于结核分枝杆菌染色体上第3332286位，其核苷酸为G/C；SNP位点187：位于结核分枝杆菌染色体上第3332665位，其核苷酸为C/T；SNP位点188：位于结核分枝杆菌染色体上第3336871位，其核苷酸为C/T；SNP位点189：位于结核分枝杆菌染色体上第3401962位，其核苷酸为G/C；SNP位点190：位于结核分枝杆菌染色体上第3402521位，其核苷酸为C/T；SNP位点191：位于结核分枝杆菌染色体上第3423423位，其核苷酸为G/A；SNP位点192：位于结核分枝杆菌染色体上第3423655位，其核苷酸为G/A；SNP位点193：位于结核分枝杆菌染色体上第3424459位，其核苷酸为C/T；SNP位点194：位于结核分枝杆菌染色体上第3424865位，其核苷酸为C/A；SNP位点195：位于结核分枝杆菌染色体上第3453393位，其核苷酸为A/G；SNP位点196：位于结核分枝杆菌染色体上第3471148位，其核苷酸为G/A；SNP位点197：位于结核分枝杆菌染色体上第3536291位，其核苷酸为T/C；SNP位点198：位于结核分枝杆菌染色体上第3536836位，其核苷酸为G/A；SNP位点199：位于结核分枝杆菌染色体上第3537013位，其核苷酸为G/A；SNP位点200：位于结核分枝杆菌染色体上第3606624位，其核苷酸为G/A；SNP位点201：位于结核分枝杆菌染色体上第3612568位，其核苷酸为G/A；SNP位点202：位于结核分枝杆菌染色体上第3626906位，其核苷酸为G/A；SNP位点203：位于结核分枝杆菌染色体上第3651143位，其核苷酸为C/T；SNP位点204：位于结核分枝杆菌染色体上第3664476位，其核苷酸为C/T；SNP位点205：位于结核分枝杆菌染色体上第3722442位，其核苷酸为C/T；SNP位点206：位于结核分枝杆菌染色体上第3786035位，其核苷酸为C/A；SNP位点207：位于结核分枝杆菌染色体上第3786186位，其核苷酸为C/G；SNP位点208：位于结核分枝杆菌染色体上第3817476位，其核苷酸为C/A；SNP位点209：位于结核分枝杆菌染色体上第3817994位，其核苷酸为C/T；SNP位点210：位于结核分枝杆菌染色体上第3913600位，其核苷酸为C/T；SNP位点211：位于结核分枝杆菌染色体上第3921273位，其核苷酸为C/T；SNP位点212：位于结核分枝杆菌染色体上第3959715位，其核苷酸为G/A；SNP位点213：位于结核分枝杆菌染色体上第3973331位，其核苷酸为C/G；SNP位点214：位于结核分枝杆菌染色体上第3979502位，其核苷酸为C/T；SNP位点215：位于结核分枝杆菌染色体上第3980169位，其核苷酸为C/G；SNP位点216：位于结核分枝杆菌染色体上第3980398位，其核苷酸为G/C；SNP位点217：位于结核分枝杆菌染色体上第3981350位，其核苷酸为T/G；SNP位点218：位于结核分枝杆菌染色体上第3981601位，其核苷酸为G/A；SNP位点219：位于结核分枝杆菌染色体上第3984549位，其核苷酸为A/G；SNP位点220：位于结核分枝杆菌染色体上第3985105位，其核苷酸为G/A；SNP位点221：位于结核分枝杆菌染色体上第3996273位，其核苷酸为G/T；SNP位点222：位于结核分枝杆菌染色体上第3996826位，其核苷酸为G/C；SNP位点223：位于结核分枝杆菌染色体上第4016684位，其核苷酸为G/A；SNP位点224：位于结核分枝杆菌染色体上第4030438位，其核苷酸为A/G；SNP位点225：位于结核分枝杆菌染色体上第4054217位，其核苷酸为C/T；SNP位点226：位于结核分枝杆菌染色体上第4054902位，其核苷酸为G/T；SNP位点227：位于结核分枝杆菌染色体上第4056097位，其核苷酸为A/G；SNP位点228：位于结核分枝杆菌染色体上第4056172位，其核苷酸为G/A；SNP位点229：位于结核分枝杆菌染色体上第4070666位，其核苷酸为G/T；SNP位点230：位于结核分枝杆菌染色体上第4090261位，其核苷酸为C/T；SNP位点231：位于结核分枝杆菌染色体上第4090846位，其核苷酸为G/A；SNP位点232：位于结核分枝杆菌染色体上第4092848位，其核苷酸为G/A；SNP位点233：位于结核分枝杆菌染色体上第4095906位，其核苷酸为C/G；SNP位点234：位于结核分枝杆菌染色体上第4125161位，其核苷酸为C/T；SNP位点235：位于结核分枝杆菌染色体上第4139309位，其核苷酸为C/T；SNP位点236：位于结核分枝杆菌染色体上第4168881位，其核苷酸为A/G；SNP位点237：位于结核分枝杆菌染色体上第4168949位，其核苷酸为C/T；SNP位点238：位于结核分枝杆菌染色体上第4201713位，其核苷酸为C/T；SNP位点239：位于结核分枝杆菌染色体上第4243424位，其核苷酸为G/T；SNP位点240：位于结核分枝杆菌染色体上第4243509位，其核苷酸为G/T；SNP位点241：位于结核分枝杆菌染色体上第4243638位，其核苷酸为C/T；SNP位点242：位于结核分枝杆菌染色体上第4244433位，其核苷酸为T/G；SNP位点243：位于结核分枝杆菌染色体上第4244598位，其核苷酸为G/C；SNP位点244：位于结核分枝杆菌染色体上第4244813位，其核苷酸为T/C；SNP位点245：位于结核分枝杆菌染色体上第4245203位，其核苷酸为A/G；SNP位点246：位于结核分枝杆菌染色体上第4245233位，其核苷酸为C/A；SNP位点247：位于结核分枝杆菌染色体上第4245325位，其核苷酸为C/T；SNP位点248：位于结核分枝杆菌染色体上第4246500位，其核苷酸为C/A；SNP位点249：位于结核分枝杆菌染色体上第4267450位，其核苷酸为T/C；SNP位点250：位于结核分枝杆菌染色体上第4267825位，其核苷酸为T/C；SNP位点251：位于结核分枝杆菌染色体上第4268036位，其核苷酸为T/C；SNP位点252：位于结核分枝杆菌染色体上第4268751位，其核苷酸为C/T；SNP位点253：位于结核分枝杆菌染色体上第4273752位，其核苷酸为T/G；SNP位点254：位于结核分枝杆菌染色体上第4274020位，其核苷酸为A/C；SNP位点255：位于结核分枝杆菌染色体上第4327554位，其核苷酸为G/C；SNP位点256：位于结核分枝杆菌染色体上第4340528位，其核苷酸为C/A；SNP位点257：位于结核分枝杆菌染色体上第4340731位，其核苷酸为A/G；SNP位点258：位于结核分枝杆菌染色体上第4343857位，其核苷酸为C/T；SNP位点259：位于结核分枝杆菌染色体上第4344236位，其核苷酸为T/C；SNP位点260：位于结核分枝杆菌染色体上第4345214位，其核苷酸为A/C；SNP位点261：位于结核分枝杆菌染色体上第4345215位，其核苷酸为C/T；SNP位点262：位于结核分枝杆菌染色体上第4345598位，其核苷酸为G/T；SNP位点263：位于结核分枝杆菌染色体上第4347515位，其核苷酸为C/A；SNP位点264：位于结核分枝杆菌染色体上第4347938位，其核苷酸为A/C；SNP位点265：位于结核分枝杆菌染色体上第4348596位，其核苷酸为G/A；SNP位点266：位于结核分枝杆菌染色体上第4349307位，其核苷酸为C/T；SNP位点267：位于结核分枝杆菌染色体上第4354191位，其核苷酸为G/A；SNP位点268：位于结核分枝杆菌染色体上第4355319位，其核苷酸为A/C；SNP位点269：位于结核分枝杆菌染色体上第4355324位，其核苷酸为A/C；SNP位点270：位于结核分枝杆菌染色体上第4355393位，其核苷酸为T/G；SNP位点271：位于结核分枝杆菌染色体上第4355616位，其核苷酸为T/C；SNP位点272：位于结核分枝杆菌染色体上第4362057位，其核苷酸为T/C；SNP位点273：位于结核分枝杆菌染色体上第4362473位，其核苷酸为A/G；SNP位点274：位于结核分枝杆菌染色体上第4362562位，其核苷酸为C/G；SNP位点275：位于结核分枝杆菌染色体上第4362656位，其核苷酸为G/A；SNP位点276：位于结核分枝杆菌染色体上第4362746位，其核苷酸为T/G；SNP位点277：位于结核分枝杆菌染色体上第4363247位，其核苷酸为T/C；SNP位点278：位于结核分枝杆菌染色体上第4363345位，其核苷酸为G/T；SNP位点279：位于结核分枝杆菌染色体上第4396673位，其核苷酸为C/A；SNP位点280：位于结核分枝杆菌染色体上第4397307位，其核苷酸为G/T；SNP位点281：位于结核分枝杆菌染色体上第4398213位，其核苷酸为T/C；SNP位点282：位于结核分枝杆菌染色体上第4398910位，其核苷酸为G/A；SNP位点283：位于结核分枝杆菌染色体上第4399563位，其核苷酸为C/T；SNP位点284：位于结核分枝杆菌染色体上第4399600位，其核苷酸为G/A；SNP位点285：位于结核分枝杆菌染色体上第4400036位，其核苷酸为G/C。