[发明专利]用于肺癌分型的方法在审
| 申请号： | 201680034117.9 | 申请日： | 2016-04-14 |
| 公开（公告）号： | CN107849613A | 公开（公告）日： | 2018-03-27 |
| 发明（设计）人： | H·法鲁基;M·莱戈德曼;G·梅休;C·佩罗;D·N·海耶斯 | 申请（专利权）人： | 基因中心治疗公司;北卡罗来纳大学教堂山分校 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C40B30/04;C40B40/06;G01N33/574 |
| 代理公司： | 北京坤瑞律师事务所11494 | 代理人： | 封新琴 |
| 地址： | 美国北卡*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 提供了用于肺癌样品的分子亚型分型的方法和组合物。具体地说，本文中提供了评估患者的腺癌肺癌亚型是终末呼吸单位(TRU)、近端炎症型(PI)还是近端增生型(PP)的方法。所述方法需要在核酸水平上检测从所述患者获得的肺癌样品中的表1‑表6的分类器生物标志物或其子集的水平。部分地基于所述分类器生物标志物的水平，将肺癌样品分类为TRU、PI或PP样品。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 肺癌 方法 | ||
【主权项】：
一种评估患者的腺癌肺癌亚型是鳞状型(squamoid)(近端炎症型)、支气管型(bronchoid)(终末呼吸单位)还是巨型(magnoid)(近端增生型)的方法，所述方法包括：(a)在核酸水平上探查从所述患者获得的肺癌样品中的表1A、表1B、表1C、表2、表3、表4、表5或表6的分类器生物标志物中的至少五种分类器生物标志物的水平，其中所述探查步骤包括；(i)将样品与与表1A、表1B、表1C、表2、表3、表4、表5或表6的至少五种分类器生物标志物的核酸分子的部分实质上互补的五种或更多种寡核苷酸在适合于所述五种或更多种寡核苷酸与其互补物或实质互补物杂交的条件下混合；(ii)检测在所述五种或更多种寡核苷酸与其互补物或实质互补物之间是否发生杂交；(iii)基于所述检测步骤获得所述至少五种分类器生物标志物的杂交值；(b)将所述至少五种分类器生物标志物的杂交值与来自至少一个样品训练集的参考杂交值比较，其中所述至少一个样品训练集包括：(i)来自样品的所述至少五种生物标志物的杂交值，所述样品过表达所述至少五种生物标志物或过表达所述至少五种生物标志物的子集，(ii)来自参考鳞状型(近端炎症型)、支气管型(终末呼吸单位)或巨型(近端增生型)样品的杂交值，或(iii)来自无腺癌的肺样品的杂交值，和(c)基于所述比较步骤的结果将所述腺癌样品分类为鳞状型(近端炎症型)、支气管型(终末呼吸单位)或巨型(近端增生型)亚型。
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