[发明专利]检测基因组编辑有效

专利信息
申请号: 201680016496.9 申请日: 2016-03-17
公开(公告)号: CN107430646B 公开(公告)日: 2021-10-22
发明(设计)人: Y·乔夫诺;N·埃雷迪亚;V·帕特尔;S·库珀;J·伯曼;E·赫夫纳 申请(专利权)人: 生物辐射实验室股份有限公司
主分类号: G16B25/20 分类号: G16B25/20;C12Q1/6851
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 陶启长;陈扬扬
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 提供方法、组合物和试剂盒,用于定量细胞基因组或细胞群的基因组中双链断裂的数量或频率。
搜索关键词: 检测 基因组 编辑
【主权项】:
一种用于定量细胞基因组中的双链断裂点数量的方法,所述方法包括:a)从所述细胞提供基因组核酸,其中所述基因组核酸在细胞中的双链断裂点插入有外源供体多核苷酸或其部分;b)将基因组核酸片段化以产生多个基因组核酸片段,其中至少一个基因组核酸片段含有所述插入的供体多核苷酸或其部分;c)产生包含环状基因组核酸片段和扩增引物对的多个混合物分区,其中所述扩增引物对与供体多核苷酸或其部分的相反链互补,并且其中所述扩增引物对定向为使得,当在环化前与含有所述插入的供体多核苷酸或其部分的基因组核酸片段杂交时,5'端彼此接近并且3'端彼此远离;d)用该扩增引物对扩增基因组核酸片段,以选择性地在包括含有所述插入的供体多核苷酸或其部分的一个或多个基因组片段的混合物分区中产生扩增子;e)检测扩增子;和f)计数含扩增子的混合物分区的数量,从而定量细胞基因组中的双链断裂点的数量。
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