[发明专利]与苹果抗炭疽菌叶枯病基因位点紧密连锁的分子标记及应用有效
| 申请号： | 201611078123.2 | 申请日： | 2016-11-18 |
| 公开（公告）号： | CN106520762B | 公开（公告）日： | 2019-02-22 |
| 发明（设计）人： | 刘源霞;兰进好;戴洪义;张玉刚;祝军 | 申请（专利权）人： | 青岛农业大学 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12Q1/6895 |
| 代理公司： | 青岛致嘉知识产权代理事务所(普通合伙) 37236 | 代理人： | 桑丹 |
| 地址： | 266109 山*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明提出一种与苹果抗炭疽菌叶枯病基因位点紧密连锁的分子标记及其应用，分子标记包括6个SNP标记以及5个InDel标记，分别为SNP3955，SNP4236，SNP4257，SNP4299，SNP4336，SNP4432，InDel4199，InDel4227，InDel4254，InDel4305及InDel4334。此外，本发明还提出筛选该标记的方法，以及上述标记的应用。本发明利用全基因组重测序技术开发出的SNP及InDel标记，结合Rgls基因初步定位结果（位于SSR标记S0304673和S0405127之间），选出在Rgls基因两侧的的SNP和InDel标记，通过HRM曲线分析技术对18个SNP位点和30个InDel位点进行了分析，筛选出6个SNP及5个InDel标记与Rgls基因位点紧密连锁。 | ||
| 搜索关键词： | 苹果 炭疽 菌叶枯病 基因 紧密 连锁 分子 标记 应用 | ||
【主权项】：
1.与苹果抗炭疽菌叶枯病基因位点紧密连锁的分子标记，其特征在于，包括6个SNP标记以及5个InDel标记，分别为SNP3955，SNP4236，SNP4257，SNP4299，SNP4336，SNP4432，InDel4199，InDel4227，InDel4254，InDel4305及InDel4334；用于扩增上述标记的引物分别为：SNP3955‑R和SNP3955‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No. 1、2所示；SNP4236‑R和SNP4236‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No. 3、4所示；SNP4257‑R和SNP4257‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No. 5、6所示；SNP4299‑R和SNP4299‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No. 7、8所示；SNP4336‑R和SNP4336‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No. 9、10所示；SNP4432‑R和SNP4432‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No.11、12所示；InDel4199‑R和InDel4199‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No.13、14所示；InDel4227‑R和InDel4227‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No.15、16所示；InDel4254‑R和InDel4254‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No.17、18所示；InDel4305‑R和InDel4305‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No.19、20所示；InDel4334‑R和InDel4334‑F核苷酸序列分别如SEQ ID No.21、22所示。
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