[发明专利]基于计算机模拟的CSFV E2蛋白靶向结合的肽配基序列设计及应用

摘要

本发明涉及基于计算机模拟的CSFV E2蛋白靶向结合的肽配基序列设计及应用，属于多肽设计及病毒抗原检测领域。其中，所述的肽配基序列为FYWRWMMK。本发明借助于分子对接及虚拟筛选技术，在黄病毒科病毒E2蛋白晶体结构的基础上，通过分子对接技术，搜寻虚拟多肽库中与靶标蛋白结合模式与亲和力最佳的肽配基，最终得到特异性结合猪瘟病毒E2蛋白的肽配基序列，其肽配基序列为FYWRWMMK，即Pep3。Pep3序列与人工表达的CSFVE2蛋白之间相互作用的平衡解离常数KD为7.54×10‑6M，即7.54μM，说明亲和力较好。本发明设计而成的Pep3序列与人工接种CSFV、人工表达CSFV E2蛋白均可以结合，除与BVDVE2蛋白反应性较高外，与其它病毒蛋白均不发生交叉性反应，特异性较好。