[发明专利]基于模块化因子图的骨髓瘤信号通路机制确认方法

摘要

本发明提供了一种基于模块化因子图的骨髓瘤信号通路机制确认方法，该方法包括步骤1、获取RPPA数据；步骤2、对所述RPPA数据进行预处理，粗粒度筛选关键蛋白质；步骤3、基于所述粗粒度筛选的关键蛋白质，构建在细胞刚性环境下，细胞内蛋白质的相互作用通路，形成信号通路；步骤4、采用常微分方程描述所述信号通路，并将所述信号通路分解成多个小模块，针对每个所述小模块，进行参数优化，建立系统生物学模型；步骤5、对所述系统生物学模型进行参数分析，所述参数分析包括稳定性分析和敏感性分析。本发明的方法有效降低了信号通路检测中系统模型的计算成本，提高了计算效率。

主权项

一种基于模块化因子图的骨髓瘤信号通路机制确认方法，其特征在于，所述方法包括：步骤1、获取RPPA数据；步骤2、对所述RPPA数据进行预处理，粗粒度筛选关键蛋白质；步骤3、基于所述粗粒度筛选的关键蛋白质，构建在细胞刚性环境下，细胞内蛋白质的相互作用通路，形成信号通路；步骤4、采用常微分方程描述所述信号通路，并使用RPPA数据中高水平表达的蛋白质在不同时间点的采样数据，确定信号通路中的关键参数；随后将所述信号通路分解成多个小模块，针对每个所述小模块，进行参数优化，获得较小的参数范围；针对优化后的信号通路，将整个信号通路分解成两个子网通路，并针对每个子网通路建立适应函数；调和所述两个子网通路中共享的蛋白质的参数，并结合所述较小的参数范围，得到一个更小的参数范围；基于所述更小的参数范围，进行参数优化，建立系统生物学模型；步骤5、对所述系统生物学模型进行参数分析，所述参数分析包括稳定性分析和敏感性分析。