[发明专利]一种用于定量分析药物干预前后生物分子网络中模块变化的方法

摘要

本发明提供一种定量分析方法，所述方法用于量化比较药物干预前后生物分子网络中模块的变化程度。所述方法整合模块不同维度(属性)的拓扑参数，构建量化模块变化的整体综合指标，定量分析比较药物干预前后生物分子网络中模块的变化程度。所述方法包括：1)分别构建药物干预前和药物干预后的生物分子网络，并分别进行模块的识别；2)匹配药物干预前和药物干预后的生物分子网络中变化的模块，确定变化模块对；3)整合表示模块不同维度的拓扑参数，结合所述拓扑参数的权值，构建模块综合评价体系，计算药物干预前后生物分子网络中模块整体构象的改变程度。本发明可应用于生物网络分析、新药研发设计、药理机制研究等领域。

主权项

1.一种用于定量分析药物干预前后生物分子网络中模块变化的方法，所述方法包括以下步骤：(1)以节点数目≥3为标准，分别对药物干预前和药物干预后的生物分子网络进行模块识别，以获得药物干预前的生物分子网络的一组模块和药物干预后的生物分子网络的一组模块；(2)将经步骤(1)识别的药物干预后的生物分子网络的一组模块与药物干预前的生物分子网络的一组模块相匹配，确定一个或多个变化模块对；(3)对于经步骤(2)获得的一个或多个变化模块对，采用整体综合指标k值对模块变化程度进行量化，其中，整体综合指标k值由描述不同维度的拓扑参数及其权值计算得到，计算公式如下：所述公式中n为选择的拓扑参数的个数，i为1至n的整数，ai为模块组中药物干预前的模块的第i个拓扑参数的空间向量特征，bi为模块组中药物干预后的模块的第i个拓扑参数的空间向量特征，di为第i个拓扑参数的空间向量特征在药物干预前后的距离，wi为每个拓扑参数的权值。