[发明专利]一种判别或比较药物作用模块的方法有效
申请号: | 201610399510.X | 申请日: | 2016-06-07 |
公开(公告)号: | CN107480467B | 公开(公告)日: | 2020-11-03 |
发明(设计)人: | 李兵;王忠 | 申请(专利权)人: | 王忠;李兵 |
主分类号: | G16B5/00 | 分类号: | G16B5/00;G16B40/00 |
代理公司: | 北京瑞恒信达知识产权代理事务所(普通合伙) 11382 | 代理人: | 张伟;张佰鹏 |
地址: | 100700 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供一种判别或比较药物作用模块的方法,所述方法包括以下步骤:(1)对两个生物网络进行模块的划分,分别得到模块集合;(2)计算两个模块集合中各个模块的一个或多个拓扑结构特征,得到单一或综合的拓扑指标,并由此计算两个模块集合中对应模块的拓扑参数变化;(3)将对应模块的拓扑参数变化与显著性界值进行比较,当两个生物网络分别为药物干预前和干预后的生物网络时,如果拓扑参数变化≥显著性界值,则所述模块为药物的作用模块;当两个生物网络分别为第一药物干预后和第二药物干预后的生物网络时,如果拓扑参数变化≥显著性界值,则所述模块为第一药物和第二药物的作用差异模块。 | ||
搜索关键词: | 一种 判别 比较 药物 作用 模块 方法 | ||
【主权项】:
一种判别或比较药物作用模块的方法,所述方法包括以下步骤:(1)对第一生物网络Gi(Vi,Ei)和第二生物网络Gj(Vj,Ej)进行模块的划分,分别得到模块集合Gi(Mi)和Gj(Mj);其中第一生物网络Gi(Vi,Ei)为药物干预前的生物网络,而第二生物网络Gj(Vj,Ej)为药物干预后的生物网络;或者第一生物网络Gi(Vi,Ei)为第一药物干预后的生物网络,而第二生物网络Gj(Vj,Ej)为第二药物干预后的生物网络;(2)计算模块集合Gi(Mi)和Gj(Mj)中各个模块的一个或多个拓扑结构特征M(t),得到单一或综合的拓扑指标T=M(t1,t2…tm),m为拓扑结构特征数目,并由此计算两个模块集合中对应模块的拓扑参数变化Δt/T;(3)将对应模块的拓扑参数变化Δt/T与显著性界值W进行比较,当第一生物网络Gi(Vi,Ei)为药物干预前的生物网络,而第二生物网络Gj(Vj,Ej)为药物干预后的生物网络时,如果Δt/T≥显著性界值W,则所述模块为所述药物的作用模块;当第一生物网络Gi(Vi,Ei)为第一药物干预后的生物网络,而第二生物网络Gj(Vj,Ej)为第二药物干预后的生物网络时,如果Δt/T≥显著性界值W,则所述模块为第一药物和第二药物的作用差异模块。
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