[发明专利]生物特征序列数据处理方法及其处理系统在审
申请号: | 201610069212.4 | 申请日: | 2016-01-27 |
公开(公告)号: | CN105760714A | 公开(公告)日: | 2016-07-13 |
发明(设计)人: | 李盼盼;师佩;吕琪;吴涛;董亚非 | 申请(专利权)人: | 陕西师范大学 |
主分类号: | G06F19/24 | 分类号: | G06F19/24;G06F19/28 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 710119 陕西*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | 本发明公开了生物特征序列数据处理方法及其系统,涉及合成生物学技术领域,该方法将从iGEM获取的数据拆分为多个特征序列,从序列、名称和类型等信息入手对特征序列进行处理,达到数据全面且无冗余的效果。 | ||
搜索关键词: | 生物 特征 序列 数据处理 方法 及其 处理 系统 | ||
【主权项】:
生物特征序列数据处理方法,其特征在于,包括以下步骤:在iGEM数据库中获取数据,并存储在原始数据表中;将所述原始数据表中每个生物质粒进行拆分,获得多个特征序列,并存储在第一特征序列表中,所述第一特征序列表中存储有每个特征序列的名称、类型和序列信息;在所述第一特征序列表中查询序列、名称和类型均相同的特征序列,每个保留一条,并存储在第二特征序列表中;在所述第二特征序列表中查询序列相同,但是名称不同的特征序列,存储在第一名称数据表中;在所述第一名称数据表中将存储的特征序列按照预设名称筛选规则进行删除,删除不符合所述预设名称筛选规则特征序列,获得第二名称数据表;在所述第二名称数据表中查询序列和名称均相同,但是类型不同的特征序列,存储在第一类型数据表中;在所述第一类型数据表中将存储的特征序列按照预设类型筛选规则进行删除,删除不符合所述预设类型筛选规则的特征序列,获得第二类型数据表;在所述第二类型数据表中查询序列中含有除a、g、c和t字符之外的字符的特征序列,并删除该些特征序列,获得第三特征序列表。
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G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
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