[发明专利]核酸序列装配的方法和系统有效
申请号: | 201580042592.6 | 申请日: | 2015-06-26 |
公开(公告)号: | CN106575322B | 公开(公告)日: | 2019-06-18 |
发明(设计)人: | M·史诺-莱文;I·麦克卡伦 | 申请(专利权)人: | 10X基因组学有限公司 |
主分类号: | G16B30/20 | 分类号: | G16B30/20 |
代理公司: | 深圳市百瑞专利商标事务所(普通合伙) 44240 | 代理人: | 金辉 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | 提供了用于分析遗传序列数据的方法、过程、且特别是计算机执行的过程和计算机程序产品。所述过程和产品用于将较短的核酸序列数据装配成较长连接的并且优选连续的遗传构建体,包括大的重叠群、染色体和整个基因组。 | ||
搜索关键词: | 核酸 序列 装配 方法 系统 | ||
【主权项】:
1.一种装配核酸序列读段的测序方法,所述测序方法包括:在计算机系统上,所述计算机系统具有一个或多个处理器,以及存储用于由所述一个或多个处理器执行的一个或多个程序的存储器:获得源自较大的连续核酸的多个序列读段,其中源自所述较大的连续核酸的共同片段的两个或更多个序列读段包括共同条形码序列,鉴定所述多个序列读段中包含重叠序列和共同条形码序列两者的序列读段的第一子集;并且比对序列读段的所述第一子集以提供连续的线性核酸序列。
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