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[发明专利]核酸序列装配的方法和系统-CN201910418296.1有效
发明人： M·史诺-莱文;I·麦克卡伦 -专利权人： 10X基因组学有限公司
申请日： 2015-06-26 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本分案申请提供了用于分析遗传序列数据的方法、过程、且特别是计算机执行的过程和计算机程序产品。所述过程和产品用于将较短的核酸序列数据装配成较长连接的并且优选连续的遗传构建体，包括大的重叠群、染色体和整个基因组。
核酸序列装配方法系统

[发明专利]用于使结构变异和相位信息可视化的系统和方法-CN201680005063.3有效
发明人： M·史诺-莱文;A·王;D·斯塔福德 -专利权人： 10X基因组学有限公司
申请日： 2016-01-13 - 公布日： 2021-10-15 - 主分类号： G16B50/00 文献下载
摘要：提供一种用于提供结构变异或相位信息的系统。所述系统存取与样本中的靶核酸对应的核酸序列数据集。所述数据集包括标头、概要和数据段。所述数据段包括多个测序读段。每一测序读段包括与所述靶核酸的子集对应的第一部分以及对多个识别符中的所述测序读段的识别符进行编码的第二部分。所述系统的存储器中的一个或多个程序使用所述系统的微处理器来提供单倍型可视化工具，所述单倍型可视化工具接收对来自所述数据集的结构变异或相位信息的请求。对照所述概要来评估所述请求，由此识别所述数据段的部分。使用所述数据段的经识别部分对结构变异或相位信息进行格式化以便在所述单倍型可视化工具中显示。
用于结构变异相位信息可视化系统方法

[发明专利]用于使用变异识别数据来确定结构变异和定相的系统和方法-CN201680007065.6有效
发明人： S·凯莉阿佐波洛-帕纳乔托波洛;P·马克斯;M·史诺-莱文;X·郑;M·雅罗什;S·萨克森诺夫;K·吉欧达;P·穆迪瓦蒂;H·奥多尼兹;J·特里;W·H·希顿 -专利权人： 10X基因组学有限公司
申请日： 2016-02-09 - 公布日： 2021-10-08 - 主分类号： C12Q1/6837 文献下载
摘要：本发明提供用于使用获自生物样本的核酸的变异识别数据来确定结构变异和定相的系统和方法。获得序列读段，每个序列读段包括对应于所述测试核酸的子集的一部分以及对独立于所述测序数据的条形码进行编码的一部分。获得单元信息。每个单元表示所述样本核酸的不同部分。每个单元对应于由所述序列读段形成的多个序列读段组中的序列读段组，使得相应的序列读段组中的每个序列读段对应于由对应于所述相应的组的所述单元表示的所述核酸的子集。二项式测试识别单元对，所述单元对具有比偶然预期更多的共同具有相同条形码的序列读段。概率模型从这些单元对的所述序列读段确定结构变异似然率。
用于使用变异识别数据确定结构系统方法

[发明专利]核酸序列装配的方法和系统-CN201580042592.6有效
发明人： M·史诺-莱文;I·麦克卡伦 -专利权人： 10X基因组学有限公司
申请日： 2015-06-26 - 公布日： 2019-06-18 - 主分类号： G16B30/20 文献下载
摘要：提供了用于分析遗传序列数据的方法、过程、且特别是计算机执行的过程和计算机程序产品。所述过程和产品用于将较短的核酸序列数据装配成较长连接的并且优选连续的遗传构建体，包括大的重叠群、染色体和整个基因组。
核酸序列装配方法系统