[发明专利]用于肺癌分型的方法在审

专利信息
申请号: 201580039130.9 申请日: 2015-06-01
公开(公告)号: CN107208131A 公开(公告)日: 2017-09-26
发明(设计)人: H·法鲁基;M·莱戈德曼;C·佩罗;D·N·海耶斯;G·梅休;C·范;M·R·米格拉雷斯 申请(专利权)人: 基因中心治疗公司;北卡罗来纳大学教堂山分校
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 北京坤瑞律师事务所11494 代理人: 封新琴
地址: 美国北卡*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 提供了用于确定肺癌样品的分子亚型的方法和组合物。具体地,本文中提供了评估患者的肺癌亚型是腺癌、鳞状细胞癌、或者是神经内分泌(涵盖小细胞癌和类癌两者)的方法。还提供了用于评估患者的肺癌亚型是腺癌、鳞状细胞癌、小细胞癌或者是类癌肺癌的方法。本文中提供的方法需要在自患者获得的肺癌样品中在核酸水平上探查表1‑表6的分类器生物标志物或其子集的水平。部分基于分类器生物标志物的水平,将肺癌样品归类为特定肺癌亚型。
搜索关键词: 用于 肺癌 方法
【主权项】:
一种评估患者的肺癌亚型是腺癌、鳞状细胞癌,或者是神经内分泌(涵盖小细胞癌和类癌)的方法,其包括(a)在核酸水平上在自所述患者获得的肺癌样品中探查表1A,表1B,表1C,表2,表3,表4,表5或表6的至少五种分类器生物标志物的水平,其中所述探查步骤包括:(i)将所述样品与五种或更多种寡核苷酸在适合于所述五种或更多种寡核苷酸与其互补物或实质性互补物杂交的条件下混合,所述五种或更多种寡核苷酸与所述表1A,表1B,表1C,表2,表3,表4,表5或表6的至少五种分类器生物标志物的核酸分子的部分实质性互补;(ii)检测在所述五种或更多种寡核苷酸与其互补物或实质性互补物之间是否发生杂交;(iii)基于所述检测步骤获得所述至少五种分类器生物标志物的杂交值;(b)将所述至少五种分类器生物标志物的杂交值与来自至少一个样品训练集的参照杂交值比较,其中所述至少一个样品训练集包含来自参照腺癌样品的杂交值、来自参照鳞状细胞癌样品的杂交值、来自参照神经内分泌样品的杂交值、或其组合;基于所述比较步骤的结果将所述肺癌样品归类为腺癌、鳞状细胞癌、或神经内分泌亚型。
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