[发明专利]使用母体血清DNA预测胎儿单基因遗传变异的方法在审
申请号: | 201580039127.7 | 申请日: | 2015-07-17 |
公开(公告)号: | CN106537401A | 公开(公告)日: | 2017-03-22 |
发明(设计)人: | 南宫锭贤 | 申请(专利权)人: | SK电信有限公社 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京北翔知识产权代理有限公司11285 | 代理人: | 张广育,姜建成 |
地址: | 韩国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | 本发明提供了通过母体游离DNA测序来非侵入性地检测、预测或诊断胎儿单核苷酸多态性及其导致的单基因疾病的方法。本发明的诊断方法不伤害母体或胎儿,并且可使用母体血液样品来分析,因而非常简便;并可有利地用于产前诊断方法,能够在早期确定而不论是否发生单核苷酸多态性引起的单基因疾病。 | ||
搜索关键词: | 使用 母体 血清 dna 预测 胎儿 基因 遗传 变异 方法 | ||
【主权项】:
一种使用母体血清DNA来检测胎儿遗传变异的方法,其包括:分析母体血清DNA以获得母体测序数据;使用所述测序数据来定义在母体单基因疾病相关的单基因中的基因缺失或重复型遗传突变类型及变异区域;通过测量具有所述遗传变异的母体血清DNA的变异区域中杂合SNP的等位基因频率而获得所测量的等位基因频率的分布;通过使用所述母体血清DNA中的胎儿DNA分数(f)并应用孟德尔定律来获得单基因的变异区域中杂合SNP的等位基因频率的预测值,当胎儿具有单基因的遗传变异时,将其作为第一预测值(θexp|aff),当胎儿不具有单基因的遗传变异时,将其作为第二预测值(θexp|unaff);以及基于所述第一预测值(θexp|aff)和第二预测值(θexp|unaff)是否落入所测量的等位基因频率分布的统计学显著性区间内,来确定胎儿是否在单基因疾病相关的单基因中具有基因缺失或重复型遗传突变。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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