[发明专利]检测表现二元表型的蛋白序列集之间的高变异区在审

专利信息
申请号: 201580016184.3 申请日: 2015-03-18
公开(公告)号: CN106460041A 公开(公告)日: 2017-02-22
发明(设计)人: 卡伦·安德森;伊曼纽尔·普鲁肖瑟曼 申请(专利权)人: 亚利桑那州立大学董事会
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/70
代理公司: 中原信达知识产权代理有限责任公司11219 代理人: 高健;缑正煜
地址: 美国亚利*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 发明提供了用于鉴定被分至不同表型数据集的序列集之间的蛋白序列差异的基于计算机的生物信息学方法,所述方法涉及查询数据库以鉴定蛋白序列的第一表型数据集和另一表型数据集内的共同序列基序,计算每个数据集的基序之间的两两相关性,并计算数据集之间的变化以鉴定在给定数据集中保守的一个或多个基序并因此与该数据集的表型相关联(图1)。
搜索关键词: 检测 表现 二元 表型 蛋白 序列 之间 变异
【主权项】:
用于鉴定被分至不同表型数据集的序列集之间蛋白序列差异的计算机执行的生物信息学方法,所述方法包括:查询数据库以鉴定蛋白序列的第一表型数据集和另一表型数据集内的共同序列基序;计算每个数据集的基序之间的两两相关性;以及计算所述数据集之间的变化以鉴定在给定数据集中保守的一个或多个基序并因此与该数据集的表型相关联。
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