[发明专利]一种毒蛾属昆虫的物种鉴别方法

摘要

本发明提供一种毒蛾属昆虫的物种鉴别方法，涉及生物技术领域。本发明方法包括如下步骤：找出毒蛾属每个种线粒体COI基因序列的差异位点，形成毒蛾属每个种的标准序列；将毒蛾属待测样品的线粒体COI基因序列与每个种的标准序列进行比对，取最大相似度值，待测昆虫隶属于最大值对应的种。本发明能够鉴定毒蛾属的昆虫，操作简单、准确性高、耗时短、特异性高，为毒蛾属昆虫的鉴定提供技术支撑。使用线粒体COI基因序列的差异位点规律作为种的鉴定特征，为物种建立身份证，准确区分近似种。本发明取待测序列各子序列依次与标准序列进行比对打分，更加合理、准确、严谨。

主权项

一种毒蛾属昆虫的物种鉴别方法，其特征在于该方法包括以下步骤：(1)下载毒蛾属昆虫的线粒体COI基因序列，进行多重序列比对，将所有序列转化为长度为L₁bp的序列，找出毒蛾属每个种的差异位点，形成毒蛾属每个种的标准序列；所述标准序列保留每个种的差异位点，其他位点用“N”补足使其长度为L₁bp；所述每个种的差异位点是指线粒体COI基因序列在种内保守、种间差异的碱基位点；(2)扩增待测样品的线粒体COI基因，进行序列检测，所述待测样品的线粒体COI基因序列长度为L₂bp；在所述待测样品线粒体COI基因序列的3’端补充“M”至长度为(L₁+L₂‑1)bp，得到待比对序列；(3)将待比对序列与每个种的标准序列进行比对，计算相似度S；所述Nm表示待比对序列与每个种的标准序列碱基匹配的位点数，Nt表示每个种的标准序列中除“N”外的碱基数量。(4)待测样品隶属于与最大相似度S相对应的种。