[发明专利]一种RNA编辑位点的特征分析方法有效
| 申请号： | 201410525810.9 | 申请日： | 2014-09-30 |
| 公开（公告）号： | CN105528532B | 公开（公告）日： | 2019-08-16 |
| 发明（设计）人： | 李欣玥;刘栋兵;熊恒 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B25/00 | 分类号： | G16B25/00;G16B50/00 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种RNA编辑位点的特征分析方法，包括步骤：对待分析样品进行测序，获得DNA和RNA数据；分析获得的数据，得到RNA编辑位点数据集；统计获得所述RNA编辑位点数据集中RNA编辑位点上下游序列的RNA二级结构自由能分布曲线。该方法能够方便、快速地对RNA编辑位点数据的基本特征进行分析。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 rna 编辑 特征 分析 方法 | ||
【主权项】：
1.一种RNA编辑位点的特征分析方法，其特征在于，包括步骤：(1)对待分析样本进行测序，获得DNA和RNA数据；(2)分析步骤(1)中获得的数据，得到RNA编辑位点数据集；(3)统计获得所述RNA编辑位点数据集中RNA编辑位点上下游序列的RNA二级结构自由能分布曲线A；(4)统计获得对照RNA编辑位点数据库中的RNA编辑位点上下游序列的RNA二级结构自由能分布曲线B，并将曲线A和曲线B进行比对，如果曲线A和曲线B大致重合，说明步骤(2)中所获得的RNA编辑位点数据集较为可靠；所述RNA二级结构自由能分布曲线的中位数位于‑55～‑70kcal/mol。
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