[发明专利]用于选择用于建模上位性效应的标记的信息处理方法和系统有效

专利信息
申请号: 201410025013.4 申请日: 2014-01-20
公开(公告)号: CN103942467B 公开(公告)日: 2018-05-25
发明(设计)人: D·霍斯;何丹;L·P·帕里达 申请(专利权)人: 国际商业机器公司
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18
代理公司: 北京市中咨律师事务所 11247 代理人: 张亚非;于静
地址: 美国*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 各个实施例选择用于建模上位性效应的标记。在一个实施例中,处理器接收基因标记集合和表型。针对基因标记集合中的每个来确定关于表型的相关性评分。基于具有最高相关性评分的基因标记的相关性评分来设置阈值。针对基因标记集合中的至少一个基因标记来确定该至少一个基因标记和基因标记集合中的至少一个其他基因标记之间的至少一个交互的相关性评分。基于该至少一个交互的相关性评分满足阈值,该至少一个交互被添加到最高k特征集。
搜索关键词: 基因标记 集合 表型 建模 信息处理 特征集 处理器
【主权项】:
1.一种用于选择用于建模上位性效应的标记的信息处理方法,该信息处理方法包括:由处理器接收基因标记集合和表型;针对基因标记集合中的每个来确定关于表型的相关性评分;基于基因标记集合中的具有最高相关性评分的基因标记的相关性评分来设置阈值;针对基因标记集合中的至少一个基因标记来确定该至少一个基因标记和基因标记集合中的至少一个其他基因标记之间的至少一个交互的相关性评分;以及基于该至少一个交互的相关性评分满足阈值,将该至少一个交互添加到最高k特征集,其中,最高k特征集中的每个特征是各包含一个最高k相关性评分的基因标记和交互中的至少一个,根据与更新的最高k个特征中的基因标记和交互中的一个关联的最高相关性评分来更新所述阈值。
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