[发明专利]用于基因型鉴定结核分枝杆菌的引物、SNP标记及方法

摘要

本申请提供用于基因型鉴定结核分枝杆菌(M.tuberculosis)之引物组，其选自引物组1至25(SEQ ID No.1至50)；亦提供用于基因型鉴定结核分枝杆菌之延伸引物，其选自SEQ ID No.51至75之一。本申请提供结核分枝杆菌之单核苷酸多态性标记之组合。本申请进一步提供用于基因型鉴定结核分枝杆菌之方法及试剂盒。

主权项

用于基因型鉴定结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)之引物组，选自下列引物组之一：引物组1：ACGTTGGATGTTCTGGACGACCTGTCCTAC(SEQ ID No.1)及ACGTTGGATGAGCTGCGCCAAGGTTCGTG(SEQ ID No.2)；引物组2：ACGTTGGATGTTGTAGCTGCCCAAATTGCC(SEQ ID No.3)及ACGTTGGATGGGCTTCAATCTCGGCTTGG(SEQ ID No.4)；引物组3：ACGTTGGATGTATTCAACACCGGCATCGGG(SEQ ID No.5)及ACGTTGGATGTCGCCTGGTCGTGGAAGAAC(SEQ ID No.6)；引物组4：ACGTTGGATGATCGGACAGCAGAAGGCAC(SEQ ID No.7)及ACGTTGGATGACTCCCGCGGAACGTGGTG(SEQ ID No.8)；引物组5：ACGTTGGATGCAACACCGGCAACTTCAAC(SEQ ID No.9)及ACGTTGGATGAATTAGCGTCTCCTCCGTTG(SEQ ID No.10)；引物组6：ACGTTGGATGTCGAACCCGCCGACAAATG(SEQ ID No.11)及ACGTTGGATGTCGATTGGTCGCATGCACTG(SEQ ID No.12)；引物组7：ACGTTGGATGAAACCTCGGCATAGGGATCG(SEQ ID No.13)ACGTTGGATGTCGACAGGACTATTGGTAGC及(SEQ ID No.14)；引物组8：ACGTTGGATGAAGACGACGGGCCGGATATG(SEQ ID No.15)及ACGTTGGATGCGTCAAGAGCTTCCCAAATC(SEQ ID No.16)；引物组9：ACGTTGGATGCATCCGGGAACACCGTAAAC(SEQ ID No.17)及ACGTTGGATGATCACCTTCTTATCGGGTGG(SEQ ID No.18)；引物组10：ACGTTGGATGCCTGGATTTCAGATATTGCC(SEQ ID No.19)及ACGTTGGATGTGGCCAGCCCTAGCAAGTC(SEQ ID No.20)；引物组11：ACGTTGGATGAGAACAAACGCGGGATTCAC(SEQ ID No.21)及ACGTTGGATGTCTCCCGGAGATCACCATTC(SEQ ID No.22)；引物组12：ACGTTGGATGGTTGTTTTTGGCCGGGCAG(SEQ ID No.23)及ACGTTGGATGATCGAGCAGACTCAGCGCTT(SEQ ID No.24)；引物组13：ACGTTGGATGTGCTACCGCCAATGTTCAAC(SEQ ID No.25)及ACGTTGGATGATGGCGTTGACATAACTCGG(SEQ ID No.26)；引物组14：ACGTTGGATGATAGCAAGCACGATTGCGAC(SEQ ID No.27)及ACGTTGGATGACCCCCCGCTGAGGGCGTA(SEQ ID No.28)；引物组15：ACGTTGGATGGATTCGATTGGGGAAACGGC(SEQ ID No.29)及ACGTTGGATGTTCCACATTGGTGATCAGCG(SEQ ID No.30)；引物组16：ACGTTGGATGCAAACGGCGTCACTTTGGTC(SEQ ID No.31)及ACGTTGGATGTGAAATGTGGGCCCAAGACG(SEQ ID No.32)；引物组17：ACGTTGGATGCGATTTCGATCGGGATGTTG(SEQ ID No.33)及ACGTTGGATGCAATCACGATCCCCTCAATC(SEQ ID No.34)；引物组18：ACGTTGGATGAGGCAAAGGAAAATCGACCG(SEQ ID No.35)及ACGTTGGATGTTGACAAACTGAAACACCGC(SEQ ID No.36)；引物组19：ACGTTGGATGACAACCGGCCGCAGCGTTT(SEQ ID No.37)及ACGTTGGATGAAGAACACCGAAAGTGGCTG(SEQ ID No.38)；引物组20：ACGTTGGATGTGCATTGGCCACTAAAGCTC(SEQ ID No.39)及ACGTTGGATGTCGATGACTATCTGCGGATG(SEQ ID No.40)；引物组21：ACGTTGGATGACCCATTTGCCGAACGTGTC(SEQ ID No.41)及ACGTTGGATGTGCTTGGCGACTTTGTGCAG(SEQ ID No.42)；引物组22：ACGTTGGATGAGCGTGAAGAAGACGACGA(SEQ ID No.43)及ACGTTGGATGGTCTGTTGTCATTACGGGAG(SEQ ID No.44)；引物组23：ACGTTGGATGACATCAGGTGATGGTCATGC(SEQ ID No.45)及ACGTTGGATGCGAAGGGAACAATGGATGTG(SEQ ID No.46)；引物组24：ACGTTGGATGTATGCCAACCGATTTGCCTG(SEQ ID No.47)及ACGTTGGATGACATATTGTCCACCGCGTAG(SEQ ID No.48)；及引物组25：ACGTTGGATGTCTTGGCAGCGGCATGGAC(SEQ ID No.49)及ACGTTGGATGCCGAATTTCCAGTCTCACAG(SEQ ID No.50)。