[发明专利]精确序列信息及修饰碱基位置确定的方法

摘要

本发明公开确认核酸样本的序列和/或核酸样本中修饰碱基的位置的方法，该核酸样本以具有已知序列的核酸插入物的环状分子呈现，该方法包含获取至少两个插入样本单元的序列信息。在一些实施例中，本发明方法包括使用环状配对互锁分子获取序列信息。在一些实施例中，本发明方法包括通过比较核酸样本序列与核酸插入物的已知序列，计算核酸插入物序列的分数，及根据紧邻于核酸样本序列的重复序列上游或下游之一个或两个插入物的序列分数，接受或拒绝该核酸样本序列的重复序列。

主权项

一种确定双链核酸样本的序列及所述序列中至少一个修饰碱基位置的方法，包括：a.将双链核酸样本的正向链及反向链锁在一起，形成一环状配对互锁分子(circular pair‑locked molecule)；b.通过单一分子测序获得所述环状配对互锁分子的序列信息，其中所述序列信息包括所述环状配对互锁分子的正向链及反向链的序列；c.通过比较所述环状配对互锁分子的正向链及反向链的序列，确定所述双链核酸样本的序列；d.改变所述环状配对互锁分子中特定类型之碱基的碱基配对特异性(base‑pairing specificity)，产生改变的环状配对互锁分子；e.获取所述改变的环状配对互锁分子的序列信息，其中所述序列信息包括所述改变的正向链及反向链的序列；及f.通过比较所述改变的正向链及反向链的序列，确定所述双链核酸样本序列中修饰碱基的位置。