[发明专利]一种基于子集错误率估计的肽鉴定方法有效
| 申请号： | 201310375508.5 | 申请日： | 2013-08-26 |
| 公开（公告）号： | CN103439441A | 公开（公告）日： | 2013-12-11 |
| 发明（设计）人： | 付岩 | 申请（专利权）人： | 中国科学院数学与系统科学研究院 |
| 主分类号： | G01N30/86 | 分类号： | G01N30/86;G01N30/72 |
| 代理公司： | 北京君尚知识产权代理事务所(普通合伙) 11200 | 代理人： | 余长江 |
| 地址： | 100190 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于子集错误率估计的肽鉴定方法，其步骤包括：1）用质谱仪分析需要鉴定的肽样品以生成串联质谱；2）把所述串联质谱搜索包含目标肽序列的目标-诱饵蛋白质数据库，将得到的肽鉴定结果按照打分从高到低排序；3）给定打分阈值x，采用迁移FDR方法估计打分高于x的第k类肽鉴定子集的错误率FDRk(x)；4）通过调整打分阈值x找到的x最小值，使得估计出的FDRk(x)小于给定的错误率控制水平α，所得打分高于x的第k类肽鉴定结果即为可以接受的可靠鉴定结果。本发明通过迁移FDR方法估计子集错误率，进而通过该子集错误率得到肽的可靠鉴定结果，具有更高的鉴定准确率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 子集 错误率 估计 鉴定 方法 | ||
【主权项】：
一种基于子集错误率估计的肽鉴定方法，其步骤包括：1）用质谱仪分析需要鉴定的肽样品以生成串联质谱；2）把所述串联质谱搜索包含目标肽序列的目标‑诱饵蛋白质数据库，将得到的肽鉴定结果按照打分从高到低排序；3）给定打分阈值x，采用迁移FDR方法估计打分高于x的第k类肽鉴定子集的错误率FDRk(x)；4）通过调整打分阈值x找到x的最小值，使得估计出的FDRk(x)小于给定的错误率控制水平α，所得打分高于x的第k类肽鉴定结果即为可靠鉴定结果。
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