[发明专利]一种基因组代谢网络初模型信息挖掘方法在审
申请号: | 201310358468.3 | 申请日: | 2013-08-16 |
公开(公告)号: | CN103399948A | 公开(公告)日: | 2013-11-20 |
发明(设计)人: | 薛卫;张梁;柴文平;倪丁香;徐焕良;任守纲 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30;G06F19/12 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 夏平 |
地址: | 211225 江苏省南京市溧*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 一种基因组代谢网络初模型信息挖掘方法,它包括以下步骤:对于KEGG网站,基于网页关键内容先验位置信息,采用网站脚本语义分析技术,提取基因-蛋白-反应之间的对应关系即确定GPR关系,建立excel表格呈现GPR关系信息,得到基因组代谢网络初模型。本方法构出的模型统一了反应格式,方便同其他模型进行比较查阅。本方法已在树干毕赤酵母基因组规模代谢网络构建中得到应用,与传统的基于KEGG数据库的网络初模型构建相比,节省了大量的劳力和时间,大大提高了构建效率。 | ||
搜索关键词: | 一种 基因组 代谢 网络 模型 信息 挖掘 方法 | ||
【主权项】:
一种基因组代谢网络初模型信息挖掘方法,其特征是它包括以下步骤:,对于KEGG网站,基于网页关键内容先验位置信息,采用网站脚本语义分析技术,提取基因‑蛋白‑反应之间的对应关系即确定GPR关系,建立excel表格呈现GPR关系信息,得到基因组代谢网络初模型。
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