[发明专利]一种基因组代谢网络初模型信息挖掘方法在审

专利信息
申请号: 201310358468.3 申请日: 2013-08-16
公开(公告)号: CN103399948A 公开(公告)日: 2013-11-20
发明(设计)人: 薛卫;张梁;柴文平;倪丁香;徐焕良;任守纲 申请(专利权)人: 南京农业大学
主分类号: G06F17/30 分类号: G06F17/30;G06F19/12
代理公司: 南京天华专利代理有限责任公司 32218 代理人: 夏平
地址: 211225 江苏省南京市溧*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 一种基因组代谢网络初模型信息挖掘方法,它包括以下步骤:对于KEGG网站,基于网页关键内容先验位置信息,采用网站脚本语义分析技术,提取基因-蛋白-反应之间的对应关系即确定GPR关系,建立excel表格呈现GPR关系信息,得到基因组代谢网络初模型。本方法构出的模型统一了反应格式,方便同其他模型进行比较查阅。本方法已在树干毕赤酵母基因组规模代谢网络构建中得到应用,与传统的基于KEGG数据库的网络初模型构建相比,节省了大量的劳力和时间,大大提高了构建效率。
搜索关键词: 一种 基因组 代谢 网络 模型 信息 挖掘 方法
【主权项】:
一种基因组代谢网络初模型信息挖掘方法,其特征是它包括以下步骤:,对于KEGG网站,基于网页关键内容先验位置信息,采用网站脚本语义分析技术,提取基因‑蛋白‑反应之间的对应关系即确定GPR关系,建立excel表格呈现GPR关系信息,得到基因组代谢网络初模型。
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