[发明专利]用于下一代测序的序列重组方法及装置有效
| 申请号： | 201280053889.9 | 申请日： | 2012-09-11 |
| 公开（公告）号： | CN103946396A | 公开（公告）日： | 2014-07-23 |
| 发明（设计）人： | 朴旻胥;金判奎 | 申请（专利权）人： | 三星SDS株式会社 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;G06F19/10;C12N15/10 |
| 代理公司： | 北京铭硕知识产权代理有限公司 11286 | 代理人： | 孙昌浩;韩明花 |
| 地址： | 韩国*** | 国省代码： | 韩国;KR |
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| 摘要： | 本发明涉及一种用于下一代测序(NGS)的序列重组方法及装置。在本发明的一优选实施例中是将序列长度为n的短序列六等分之后只将前3个片段利用为种子，并检索以参考序列为基础生成的哈希表而检索映射候选位置。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 下一代 序列 重组 方法 装置 | ||
【主权项】：
一种用于下一代测序的序列重组方法，其特征在于，包括如下步骤：将序列长度为n的短序列六等分；针对参考序列以n/6大小的子序列单位生成哈希值而构成哈希表；在将所述短序列六等分的片段中，将位于所述短序列的前部的3个片段分别利用为种子；计算所述3个种子的哈希值；从所述哈希表中检索与所述3个种子的哈希值一致的哈希值而检索映射候选位置。
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