[发明专利]基因测序数据读取方法及系统有效
| 申请号： | 201210592061.2 | 申请日： | 2012-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN103049680A | 公开（公告）日： | 2013-04-17 |
| 发明（设计）人： | 孟金涛;魏延杰;成杰峰;冯圣中 | 申请（专利权）人： | 深圳先进技术研究院 |
| 主分类号： | G06F19/20 | 分类号： | G06F19/20;G06F17/21 |
| 代理公司： | 深圳市科进知识产权代理事务所(普通合伙) 44316 | 代理人： | 宋鹰武 |
| 地址： | 518055 广东省深圳*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明涉及生物信息学技术领域，提出了一种基因测序数据读取方法，包括如下步骤：对用户参数进行解析，确定任务个数；根据任务个数将测序数据分割成相同大小的文件块；对每个文件块的起始地址和终止地址进行调整；各任务对调整后的文件块结果进行读取。本发明还提供了基因测序数据读取系统及设有所述系统的基因测序数据分析装置。本发明实现了基因测序数据的并行读取，且各个文件块大小均匀，还避免了将一个序列分割到两个不同的文件块中。 | ||
| 搜索关键词： | 基因 序数 读取 方法 系统 | ||
【主权项】：
一种基因测序数据读取方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤a：对用户参数进行解析，确定任务个数；步骤b：根据任务个数将测序数据分割成相同大小的文件块；步骤c：对每个文件块的起始地址和终止地址进行调整；步骤d：各任务对调整后的文件块结果进行读取。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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