[发明专利]一种以人乳头瘤病毒HPV的DNA解旋酶E1为靶点的抗HPV病毒药物的虚拟筛选方法有效
| 申请号： | 201210195233.2 | 申请日： | 2012-06-14 |
| 公开（公告）号： | CN102750459A | 公开（公告）日： | 2012-10-24 |
| 发明（设计）人： | 芦秀丽;高兵;张勇;陈树超;刘汀;贾丹 | 申请（专利权）人： | 辽宁大学 |
| 主分类号： | G06F19/16 | 分类号： | G06F19/16;A61K45/00;A61P35/00;A61P31/20 |
| 代理公司： | 沈阳杰克知识产权代理有限公司 21207 | 代理人： | 金春华 |
| 地址： | 110136 辽宁*** | 国省代码： | 辽宁;21 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种以人乳头瘤病毒HPV的DNA解旋酶E1为靶点的抗HPV病毒药物的虚拟筛选方法。包括以下步骤：1）确定E1蛋白结构的PDB结构数据；2）采用分子对接软件，依据E1的活性氨基酸残基位点确定活性中心，设定活性口袋；3）对小分子配体进行筛选；4）建立对接用小分子配体数据库；5）根据设定的活性口袋，利用分子对接软件，将对接用小分子配体数据库中的小分子配体与活性口袋一一做对接；6）根据对接结果的排序，初步确定具有抗宫颈癌效果的先导药物。采用本发明可在短时间内获得活性化合物的线索，然后再利用动物水平筛选或者高通量细胞平台筛选具有抗宫颈癌药物，大大提高了速度和效率，缩短新药研究周期。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 乳头 病毒 hpv dna 解旋酶 e1 药物 虚拟 筛选 方法 | ||
【主权项】：
一种以人乳头瘤病毒HPV的DNA解旋酶E1为靶点的抗HPV病毒药物的虚拟筛选方法，其特征在于：包括以下步骤：1）确定E1蛋白结构的PDB晶体结构数据；2）采用分子对接软件，依据E1的活性氨酸残基位点确定分子对接的活性中心，设定活性口袋；3）对小分子配体进行筛选，筛选项目为毒性筛选、类药性筛选；4）建立对接用小分子配体数据库；5）根据设定的活性口袋，利用分子对接软件，将对接用小分子配体数据库中的小分子配体与活性口袋一一做对接；6）根据对接结果的排序，小分子配体与活性中心的相互作用方式，进行综合评价，初步确定具有抗HPV病毒效果的先导药物。
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