[发明专利]HGF基因的Poly A重复单元数目突变多态性检测用探针及其用途

摘要

本发明提供HGF基因的poly A重复单元数目突变多态性检测用探针及其用途。所述多态性检测用探针为用于检测HGF基因的多态性的探针，其由(P1-1)、(P1-2)、(P1’-1)、(P1’-2)、(P2-1)、(P2-2)、(P2’-1)、(P2’-2)、(P3-1)、(P3-2)、(P3’-1)和(P3’-2)中的至少一种荧光标记寡核苷酸构成。例如(P1-1)为如下荧光标记寡核苷酸，其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95～100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号95～100的3’末端和所述碱基编号132之间的1～31个碱基中任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为8～94个碱基长的碱基序列互补，其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下，相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，并且所述与碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记。

主权项

一种多态性检测用探针，其是用于检测HGF基因的多态性的探针，其特征在于，其由从下述(P1‑1)、(P1‑2)、(P1’‑1)、(P1’‑2)、(P2‑1)、(P2‑2)、(P2’‑1)、(P2’‑2)、(P3‑1)、(P3‑2)、(P3，‑1)和(P3’‑2)的组中选择的至少一种荧光标记寡核苷酸构成：(P1‑1)荧光标记寡核苷酸，其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95～100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号95～100的3’末端和所述碱基编号132之间的1～31个碱基中任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为8～94个碱基长的碱基序列互补，其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下，相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，并且所述与碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记；(P1‑2)荧光标记寡核苷酸，其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95～100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号95～100的3’末端和所述碱基编号132之间的1～31个碱基中任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为8～94个碱基长的碱基序列互补，其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下，与序列编号3的碱基序列在严谨条件下杂交，并且所述与碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记；(P1’‑1)荧光标记寡核苷酸，其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95～100以及由夹在所述碱基编号95～100的3’末端和碱基编号132之间的1～31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为7～55个碱基长的碱基序列互补，其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下，相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，与所述碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记；(P1’‑2)荧光标记寡核苷酸，其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号95～100以及由夹在所述碱基编号95～100的3’末端 和碱基编号132之间的1～31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为7～55个碱基长的碱基序列互补，其在与碱基编号95对应的碱基为胞嘧啶的条件下，与序列编号3的碱基序列在严谨条件下杂交，并且所述与碱基编号95对应的碱基用荧光染料标记；(P2‑1)荧光标记寡核苷酸，其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号92～100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号92～100的3’末端和所述碱基编号132之间的1～31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为11～94个碱基长的碱基序列互补，其在与碱基编号92对应的碱基为胞嘧啶的条件下，相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，并且所述与碱基编号92对应的碱基用荧光染料标记；(P2‑2)荧光标记寡核苷酸，其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号92～100、碱基编号132、以及由夹在所述碱基编号92～100的3’末端和所述碱基编号132之间的1～31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为11～94个碱基长的碱基序列互补，其在与碱基编号92对应的碱基为胞嘧啶的条件下、与序列编号3的碱基序列在严谨条件下杂交，并且所述与碱基编号92对应的碱基用荧光染料标记；(P2’‑1)荧光标记寡核苷酸，其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号92～100以及由夹在所述碱基编号92～100的3’末端和碱基编号132之间的1～31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为10～55个碱基长的碱基序列互补，其在与碱基编号92对应的碱基为胞嘧啶的条件下、相对于与序列编号3互补的碱基序列具有至少80％以上的同一性，并且所述与碱基编号92对应的碱基用荧光染料标记；(P2’‑2)荧光标记寡核苷酸，其碱基序列与含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号92～100以及由夹在所述碱基编号92～100的3’末端和碱基编号132之间的1～31个碱基中的任意个数的连续的T构成的子碱基序列且长度为10～55个碱基长的碱基序列互补，其在与碱基编号92对 应的碱基为胞嘧啶的条件下，与序列编号3的碱基序列在严谨条件下杂交，与所述碱基编号92对应的碱基用荧光染料标记；(P3‑1)荧光标记寡核苷酸，其为8～120个碱基长的碱基序列，且含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号100、碱基编号132～134、以及由夹在所述碱基编号100和所述碱基编号132～134的5’末端之间的4～31之间任意个数的连续的T构成的子碱基序列，其在碱基编号134的碱基为胞嘧啶的条件下，相对于序列编号3的碱基序列具有至少80％以上的同一性，并且所述碱基编号134的碱基用荧光染料标记；(P3‑2)荧光标记寡核苷酸，其为8～120个碱基长的碱基序列，且含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号100、碱基编号132～134、以及由夹在所述碱基编号100和所述碱基编号132～134的5’末端之间的4～31之间任意个数的连续的T构成的子碱基序列，其在碱基编号134的碱基为胞嘧啶的条件下，和与序列编号3互补的碱基序列在严谨条件下杂交，并且所述碱基编号134的碱基用荧光染料标记；(P3’‑1)荧光标记寡核苷酸，其为8～56个碱基长的碱基序列，且含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号132～134以及由夹在碱基编号100和所述碱基编号132～134的5’末端之间的5～31之间任意个数的连续的T构成的子碱基序列，其在碱基编号134的碱基为胞嘧啶的条件下，相对于序列编号3的碱基序列具有至少80％以上的同一性，并且所述碱基编号134的碱基用荧光染料标记；(P3’‑2)荧光标记寡核苷酸，其为8～56个碱基长的碱基序列，且含有序列编号3所示的碱基序列的碱基编号132～134以及由夹在碱基编号100和所述碱基编号132～134的5’末端之间的5～31之间任意个数的连续的T构成的子碱基序列，其在碱基编号134的碱基为胞嘧啶的条件下，和与序列编号3互补的碱基序列在严谨条件下杂交，并且所述碱基编号134的碱基用荧光染料标记。