[发明专利]药物发现的方法

摘要

一种获得关于靶分子化学活性区域信息的方法，例如用于药物开发，包括：提供一组基本刚性的量规；使靶点与所述量规组中许多量规反应；测试所述量规与所述靶点的结合以获得许多测试结果；以及分析所述测试结果以获得关于所述化学活性区域的信息。

主权项

获得关于靶分子的化学活性区域信息的方法，包括：提供一组化合物，包括许多基本刚性的化学量规；所述量规的每一种提供至少一种基本刚性的三角形部分，使所述的靶点与所述量规相互作用；测试所述量规与所述靶点的相互作用以获得许多测试结果；以及分析所述测试结果以获得关于所述化学活性区域的信息，其中，选择所述化合物组以使包含至少50％的所述空间化学构型空间的部分空间化学构型空间被所述量规的基本刚性的三角形部分所跨越，具有重叠因子为6，从而使得对于由所述部分包括的结合位点的各个三角形构型，所述多个量规包含至少6个具有基本上刚性的三角形部分的量规能够与所述结合位点的三角形构型进行化学上的结合，所述的空间化学构型空间包括结合位点的三角形构型，该结合位点由在所述三角形构型的顶点的化学结合位点类型以及由所述三角形构型的顶点之间的三重距离所定义，各化学结合位点类型选自负电荷、正电荷、疏水、氢键供体、氢键受体，和芳香环，各距离在2至12埃的范围。