[发明专利]一种FGFR3基因突变检测特异性引物和液相芯片

摘要

本发明公开了一种FGFR3基因检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有：每种由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成的ASPE引物，所述特异性引物序列为：SEQ ID NO.22及SEQ ID NO.23；SEQ ID NO.24及SEQ ID NO.25；SEQ ID NO.26及SEQ ID NO.27；SEQ ID NO.28及SEQ ID NO.29；SEQ ID NO.30及SEQ IDNO.31；SEQ ID NO.32及SEQ ID NO.33；SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35；SEQ ID NO.36以及选自SEQ ID NO.37、SEQ ID NO.38、SEQ ID NO.39、SEQ ID NO.40中的一种以上；和/或SEQ ID NO.41及SEQ ID NO.42；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明所提供的检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％，实现多个突变位点的野生型和突变型并行检测。

主权项

一种FGFR3基因突变检测液相芯片，其特征是，包括有：(A).针对FGFR3基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对R248C位点的SEQ ID NO.22及SEQ ID NO.23；针对G370C位点的SEQ ID NO.24及SEQ ID NO.25；针对S371C位点的SEQ ID NO.26及SEQ ID NO.27；针对Y373C位点的SEQID NO.28及SEQ ID NO.29；针对G380R位点的SEQ ID NO.30及SEQ ID NO.31；针对A391E位点的SEQ ID NO.32及SEQ ID NO.33；针对D641N位点的SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35；针对K650Q/E/T/M位点的SEQ ID NO.36以及选自SEQ ID NO.37、SEQ ID NO.38、SEQ IDNO.39、SEQ ID NO.40中的一种以上；和/或针对G697C位点的SEQ ID NO.41及SEQ ID NO.42，所述tag序列选自SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.21；(B).有anti‑tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti‑tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti‑tag序列选自SEQ ID NO.43～SEQ ID NO.63，且所述anti‑tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。