[发明专利]一种DNA序列数据压缩系统有效
| 申请号： | 201110002601.2 | 申请日： | 2011-01-07 |
| 公开（公告）号： | CN102081707A | 公开（公告）日： | 2011-06-01 |
| 发明（设计）人： | 纪震;周家锐;朱泽轩;储颖 | 申请（专利权）人： | 深圳大学 |
| 主分类号： | G06F19/10 | 分类号： | G06F19/10 |
| 代理公司： | 深圳市君胜知识产权代理事务所 44268 | 代理人： | 王永文;杨宏 |
| 地址： | 518060 广东*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种DNA序列数据压缩系统，是一种基于MA-ARV码本的DNA序列数据无损压缩系统，可在全序列上搜索MA-ARV码矢量的近似重复片段，并使用文化基因启发式优化算法(MA)对压缩码本的构造过程进行优化，从而更全面地利用DNA序列数据的重复特性，有效消除冗余。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 dna 序列 数据压缩 系统 | ||
【主权项】：
一种DNA序列数据压缩系统，其特征在于，所述DNA序列数据压缩系统包括：MA‑ARV码本设计模块，用于构造针对当前输入DNA序列数据的压缩码本；DNA序列数据压缩模块，用于根据MA‑ARV码本对输入数据进行无损压缩编码；DNA序列数据解压模块，用于对压缩后的数据文件进行解压恢复操作。
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G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
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