[发明专利]以Alu间聚合酶链式反应为基础的检测基因区特征的方法无效
| 申请号： | 201010139483.5 | 申请日： | 2010-03-30 |
| 公开（公告）号： | CN101792808A | 公开（公告）日： | 2010-08-04 |
| 发明（设计）人： | 薛红;梅玲玲 | 申请（专利权）人： | 广州市香港科大霍英东研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人： | 华辉;刘菁菁 |
| 地址： | 511548 广东省广州*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明涉及集中扩增并检测基因组DNA基因区的方法，目的在于探明基因组中基因区的特征。这些特征包括单核苷酸多态性(SNP)、点突变，序列插入/缺失及双脱氧核苷酸分子(DNA)甲基化CpG位点的水平。该方法以Alu家族，特别是AluY亚家族共同序列为主要寡核苷酸引物，利用多寡核苷酸引物Alu间聚合酶链式反应(inter-Alu PCR)扩增基因组DNA，扩增DNA复制子多集中于基因组中各基因区。该方法的特点在于，通过inter-Alu PCR可过滤掉部分非基因区序列，使新一代测序技术集中检测基因区的SNP、点突变，序列插入/缺失及DNA甲基化CpG位点的水平，并可节省测序所需基因组DNA用量。 | ||
| 搜索关键词： | alu 聚合 链式反应 基础 检测 基因 特征 方法 | ||
【主权项】：
以Alu间聚合酶链式反应为基础的检测基因区特征的方法，包括以下步骤：(1)以Alu家族共同序列为主要寡核苷酸引物，利用单一或多寡核苷酸引物作为引物对样本DNA进行inter-Alu PCR扩增；(2)采用循环阵列合成测序法为基础的高通量测序仪器进行测序；(3)对测序结果进行基因组中基因区单核苷酸多态性(SNP)、点突变，插入/缺失及双脱氧核苷酸分子(DNA)甲基化CpG位点的检测。
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