[发明专利]沙门氏菌血清组鉴定靶点的筛选方法无效
| 申请号： | 201010118902.7 | 申请日： | 2010-03-08 |
| 公开（公告）号： | CN101928772A | 公开（公告）日： | 2010-12-29 |
| 发明（设计）人： | 史贤明;刘斌;施春雷;张利达;朱东升 | 申请（专利权）人： | 上海交通大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12R1/42 |
| 代理公司： | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人： | 王锡麟;王桂忠 |
| 地址： | 200240 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 一种食品安全技术领域的沙门氏菌血清组鉴定靶点的筛选方法，包括如下步骤：获取所有沙门氏菌的基因组DNA序列，按照血清型进行分类，拼接，得长序列，格式化成BLASTN程序文件；从目标血清型中选择一个代表菌株，切割其基因组DNA序列，得到小片段，将所有小片段与该血清型对应的长序列进行比对，选择E值趋近于0的DNA片段；之后将得到的DNA片段与其余血清型对应的长序列分别进行比对，选择最终E值均＞1的DNA片段；以步骤二最终所得DNA片段为模板，设计引物，扩增所有基因组DNA，检测扩增产物；只有属于目标血清型的基因组DNA序列能扩增到特异扩增条带时，则相应DNA片段为目标血清型的特异靶点。本发明的方法实施简便、结果准确，能够提供可靠的特异靶点。 | ||
| 搜索关键词： | 沙门氏菌 血清 鉴定 筛选 方法 | ||
【主权项】：
一种沙门氏菌血清组鉴定靶点的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤一，获取已经测序完成的沙门氏菌的基因组DNA序列，按照沙门氏菌的血清型进行分类，拼接每种血清型下的所有基因组DNA序列，得长序列，利用BLASTN软件格式化成BLASTN程序文件；步骤二，从目标血清型中选择一个代表菌株，切割其基因组DNA序列，得到小片段，将所有小片段与该血清型对应的长序列进行比对，选择E值趋近于0的DNA片段；之后将得到的DNA片段与其余血清型对应的长序列分别进行比对，选择最终E值均＞1的DNA片段；步骤三，以步骤二最终所得DNA片段为模板，设计引物；利用引物扩增每种血清型下对应的所有基因组DNA，检测扩增产物；只有属于目标血清型的基因组DNA序列能扩增到特异扩增条带时，则相应DNA片段为目标血清型的特异靶点。
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