[发明专利]描述蛋白质的构象和根据折叠、整体形状与结构序列对其进行评价的方法、系统及装置

摘要

本发明提供了描述蛋白质的构象和根据折叠、整体形状与结构序列对其进行评价的方法、系统及装置。本发明的系统方法可以具体表达在计算机和任何一种可以运作该方法步骤的仪器中。系统方法涵盖单个或者多个蛋白质片段，单个或者多个完整的蛋白质，一对或者多对蛋白质的比较，以及理论预测或者实验测试的蛋白质。因此，本发明的方法可以应用于任何计算机和计算机芯片来执行有关蛋白质及其片段的构象的分析，以及在制备用于与蛋白质折叠或错误折叠有关的疾病的检测或治疗药物中的应用。

主权项

1、一种分析或表达由一个连续序列的氨基酸链构成的蛋白质或其部分的构象的方法，其特征在于，该方法包括以下步骤：A、把所述蛋白质或其最少一个部分分解成多个基本单元，每个单元包含五个连续的氨基酸；所述五个连续的氨基酸包括一个第一氨基酸、一个第二氨基酸、一个第三氨基酸、一个第四氨基酸和一个第五氨基酸，其中每一个氨基酸都含有一个α-碳原子；B、对第一单元确定第一二面角的区间值，其中，第一二面角根据第一平面和第二平面来确定，其中，第一平面由第一、第二和第三氨基酸的α-碳原子确定，第二平面由第二、第三和第四氨基酸的α-碳原子确定，第一二面角在第一平面和第二平面之间；C、对第一单元确定第二二面角的区间值，其中，第二二面角根据第二平面和第三平面来确定，其中，第三平面由第三、第四和第五氨基酸的α-碳原子确定，第二二面角在第二平面和第三平面之间，其中，第二二面角的区间值从区间b1、b2和b3所构成的区间组选取；D、对第一单元确定伸展距离的区间值，其中，伸展距离是第一氨基酸的α-碳原子与第五氨基酸的α-碳原子之间的距离，其中，伸展距离区间值从区间c1、c2、和c3所构成的区间组选取；E.组合从步骤B、C和D得到的区间值获得第一单元向量。