本发明公开了一种鉴定弱仔猪发生的分子标志物、检测方法、引物组及应用,涉及分子生物学技术领域,该分子标志物为位于国际猪参考基因组11.1版本参考序列2号染色体上9380300~9384299bp所在位置的PHEROC基因启动子区域片段,其核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。根据核苷酸序列如SEQ IDNO.1和SEQ ID NO.2所示的引物组进行猪基因组的PCR扩增,并对扩增产物进行甲基化检测,根据该片段第83位、461位、2473位、3493位、3559位和3685位点的的甲基化情况判断是否存在弱仔猪发生的风险,为母猪产弱仔猪的预防提供有效的检测手段。