本发明涉及基因工程技术领域，具体涉及不结球白菜自交亲和性相关的等位基因及其应用。本发明通过表型筛选，鉴定到一个表现为自交亲和的不结球白菜材料，进一步采用遗传分析、基因克隆、表达分析和序列比对分析等技术手段成功分离得到一个新的不结球白菜自交不亲和位点等位基因，该基因可导致不结球白菜表现为彻底的自交亲和。本发明所提供的等位基因，其核苷酸序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.3所示。本发明还进一步提供了所述等位基因的分子标记，以及所述等位基因、分子标记的应用。本发明获得的自交亲和性状相关等位基因将极大提高育种效率，降低制种成本。
本发明公开了一种小白菜隐性细胞核不育基因Brams，该基因的gDNA序列如SEQ ID NO.1所示，其CDS序列如SEQ ID NO.2所示，编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示。与保持系可育株相比，该基因存在一段369bp的插入变异，该插入区段含有5个终止密码子，提前终止蛋白的翻译，从而影响花药的发育表现为不育，但对其他基因功能没有影响，其在不同的遗传背景下不育性很稳定，因此可用于选育小白菜隐性细胞核不育系。
