本申请提供了一种用于鉴别黑老虎的引物对,所述引物对包括:引物对1,和/或,序引物对2;所述引物对1的序列为SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2;所述引物对2的序列为SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4。本申请从分子水平探讨黑老虎品种间的遗传关系,还可从分子水平上发现黑老虎物种间密切联系的物种,从而发现可替代的新的资源物种,这将大为加快黑老虎新资源寻找的进程,为黑老虎品种及其近缘品种的快速准确鉴定、系统发育关系等提供了最本质的依据;同时,可避免因误选种苗造成损失,以及为优良种质的选择提供指导,有利于黑老虎资源保护开发与可持续利用。