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[发明专利]蛋白质编码方法及蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统-CN201910253412.9有效
发明人：薛宇;宁万山;许浩东;邓万锟;郭亚萍 -专利权人：华中科技大学
申请日： 2019-03-29 - 公布日： 2020-12-08 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：本发明公开了蛋白质编码方法及蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统，属于生物信息学领域。所述蛋白质编码方法包括收集修饰位点信息、位置权重训练和待编码肽段的编码。蛋白质翻译后修饰位点预测方法包括收集修饰位点信息、特征编码、模型训练和蛋白质翻译后修饰位点预测。本发明利用深度神经网络和惩罚逻辑回归分别对不同类别的阳性位点和阴性位点的数字向量特征构建预测模型，得到多个预测模型；将每个预测模型的预测结果作为新的特征并利用惩罚逻辑回归构建最终模型。本发明可以捕获更多蛋白信息从而有助于提高预测的准确度，可以快速的大规模鉴定蛋白质修饰位点。
蛋白质编码方法翻译修饰预测系统

[发明专利]一种分析预测癌症突变影响LIR模体功能的方法-CN201810378036.1有效
发明人：薛宇;邓万锟;贾大 -专利权人：华中科技大学
申请日： 2018-04-25 - 公布日： 2019-12-06 - 主分类号： G16B15/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种分析预测癌症突变影响LIR模体功能的方法，包括以下步骤：(1)利用LIR模体数据训练预测模型；(2)利用模型对癌症突变前后的肽段数据分别打分；(3)利用模型对候选肽段的肽段数据进行打分，得出打分结果与该候选肽段对应的肽段数据其属于真实LIR模体或非真实LIR模体的贝叶斯概率之间的关系，接着将癌症突变前后对应的肽段分别作为候选肽段，并代入步骤(2)中的打分结果，得到癌症突变前后对应的肽段它们的贝叶斯概率；(4)计算该癌症突变对于LIR功能的可选影响方式的概率。本发明通过利用LIR模体数据、以及癌症突变前后对应的肽段数据，系统性的研究癌症突变对LIR模体功能的影响，能够预测出癌症突变对于LIR功能的可选影响方式的概率。
突变癌症模体肽段候选肽概率影响方式贝叶斯可选预测数据训练预测模型分析研究

[发明专利]一种基于概率密度估计的数据差异分析方法及系统-CN201910471042.6在审
发明人：薛宁;宁万山;许浩东;邓万锟;郭亚萍 -专利权人：华中科技大学
申请日： 2019-05-31 - 公布日： 2019-09-17 - 主分类号： G06F16/2455 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于概率密度估计的数据差异分析方法及系统，属于数据分析领域。该方法为先建立数据集，数据集中的数据均发生了变化；然后利用概率密度估计法去估计变化前后数据联合概率；根据最大似然法去选择最佳的窗口宽度，对不同的窗口宽度，每次取数据集中的任意一个点，用数据集中剩下的点去构建联合概率分布，计算该任意一个点在该联合概率分布上的联合概率密度值，得到的多个个联合概率密度值之积为似然值，使似然值最大的窗口宽度为最佳窗口宽度；根据该最佳窗口宽度，通过概率密度估计法得到变化前后数据联合概率密度分布，并分析数据的差异。本方法可以不受数据分布的限制求得每个数据的显著程度，用于发现显著变化的数据。
概率密度估计数据集中联合概率分布数据差异分析概率数据联合最大似然法分析数据密度分布数据分布数据分析显著变化数据集构建联合发现