本发明涉及基因芯片,具体地说,是一种唇腭裂易感基因检测芯片及检测方法。所述芯片包括基片和位于基片上的核酸探针,核酸探针包括核酸序列为SEQ ID NO.1-34的核苷酸序列,所述探针的3’端进行氨基修饰。本发明的唇腭裂易感基因的基因芯片用以检测各基因与唇腭裂之间的关系。该基因芯片将所有基因中可能与唇腭裂发生相关的位点探针集成到一张芯片上,利用碱基互补杂交方法,实现了高通量,快速,准确的检测。通过唇腭裂易感基因检测芯片可快速简便的对易感人群进行基因筛查,可在孕早期或孕前预测出高危人群,从而通过减少接触危险因素,改善条件等手段,预防和降低唇腭裂的发生。