本发明公开了一种与小麦实心茎抑制基因紧密连锁的KASP引物及其应用，涉及遗传育种技术领域，该KASP引物包含核苷酸序列分别如SEQ IDNO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6所示的3条引物。由该KASP引物扩增所得KASP分子标记KASP‑669为共显性标记。本发明提供的KASP引物能准确地跟踪小麦实心茎抑制基因，鉴定小麦茎秆的性状，能够提高实心茎小麦创制的准确性，可用于小麦抗倒伏育种，大大加快实心茎小麦品种的选育进程。
本发明公开了与小麦抗条锈病基因QYr.sicau.‑2BL连锁的SNP分子标记及应用，属于分子育种技术领域。所述SNP分子标记利用如SEQ ID NO.1～3所示特异性引物组扩增得到；所述SNP分子标记与小麦抗条锈病QTL QYr.sicau.‑2BL共定位于小麦2B染色体长臂上，多态性为T/C。该分子标记能准确跟踪所述小麦抗条锈病基因QYr.sicau‑2BL，预测小麦的抗条锈病特性，进而方便进行分子设计育种。本发明还提供鉴定小麦抗条锈病的方法，能够加强抗条锈病预测的准确性，便于快速筛选出抗条锈病的小麦品种或品系，大大加快小麦高产量品种的选育进程。
本发明公开了一种二倍体野生一粒小麦4Ab染色体分子标记引物对及其应用，该引物对选自以下任意一对引物：核苷酸序列如SEQ ID NO.1～2所示的引物对1至核苷酸序列如SEQ ID NO.65～66所示的引物对33。本发明利用SLAF‑seq技术对普通小麦Crocus、野生一粒小麦G52、普通小麦‑野生一粒小麦4Ab(4B)代换系Z18‑1244进行测序，通过序列比对，获得了野生一粒小麦4Ab染色体特异序列，以这些序列为基础，开发了野生一粒小麦4Ab染色体的特异分子标记，并在小麦及其近缘属物种中进行了验证，可用于野生一粒小麦4Ab染色体或片段的快速检测。
本发明公开了一种野生一粒小麦蓝粒性状主效基因及其分子标记和应用，该基因为普通小麦‑野生一粒小麦4Ab(4B)代换系中鉴定的野生一粒小麦基因，所述基因为调控野生一粒小麦蓝粒性状的主效基因，可调控花青素合成。野生一粒小麦蓝粒主效基因核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其编码蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明对研究野生一粒小麦花青素合成机制提供了基础，也为基因工程手段改造植物从而提高花青素的含量提供了方向和靶点。
